Penenggelamannya berujung pada insiden maritim tunggal terbesar di laut sepanjang sejarah Angkatan Laut Amerika Serikat. Pada 30 Juli 1945, setelah sebuah perjalanan berkecepatan tinggi untuk mengirim bagian-bagian dari Little Boy (bom atom pertama yang dipakai dalam serangan ke Jepang), ke pangkalan udara Amerika Serikat di Tinian. Indianapolis ditorpedo oleh kapal selam Angkatan Laut Kekaisaran JepangI-58 saat menuju ke Filipina dan tenggelam dalam 12 menit. Dari 1.196 anggota kru yang ada didalamnya, sekitar 300 orang tenggelam dalam kapal tersebut. 900 orang sisanya menghadapi kedinginan, dehidrasi, keracunan air laut, dan serangan hiu saat berada di atas sekoci hampir tanpa makanan ataupun air. Angkatan Laut Amerika Serikat baru mengetahui penenggelaman tersebut saat para penyintas diselamatkan empat hari kemudian oleh para kru PV-1 Ventura, saat mereka melakukan patroli rutin. Hanya 317 orang yang selamat.
Dictionary of American naval fighting ships / Vol.3, Historical sketches : letters G through K, Washington, D.C.: Department of the Navy, 1981, ISBN978-0160020186
Hashimoto, Mochitsura (2010) [1954]. Sunk: The Story of the Japanese Submarine Fleet, 1941–1945. New York: Henry Holt; reprint: Progressive Press. ISBN1-61577-581-1.
Lech, Raymond B.All the Drowned Sailors, Jove Books, New York, ASIN: B000UE9796
Marks, R. Adrian (April 1981). "America was Well Represented". United States Naval Institute Proceedings.
IndySurvivor.com - website and book by survivor Edgar Harrell, USMC
Announcement of the Father Thomas Conway Memorial (June 2006). (At USS Indianapolis Museum official website, in the left-hand column, click on "2006 Museum Activities".)