NACHT domen
| NACHT domen | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||
| Simbol | NACHT | ||||||||
| Pfam | PF05729 | ||||||||
| InterPro | IPR007111 | ||||||||
| PROSITE | PS50837 | ||||||||
| |||||||||
NACHT domen je evolucijski konzervirani proteinski domen. Ovaj NTPazni domen nalazi se u apoptoznim proteinima kao i u onima koji su uključeni u transkripciju MHC.[1] Njegovo ime odražava neke od proteina koji ga sadrže: NAIP (apoptoza porodice NLP inhibitor proteina), CIITA (tj. C2TA ili aktivator transkripcije MHC klase II), HET-E (protein lokusa nekompatibilnosti iz Podospora anserina) i TEP1 (tj. TP1 ili protein povezan s telomerazom).
NACHT domen sadrži 300 do 400 aminokiselina. To je predviđeni nukleozid-tifosfatazni (NTPazni) domen, koji se nalazi u životinjskim, gljivičnim i bakterijskim proteinima. Nalazi se u vezi sa drugim domenima, kao što su CARD domen (InterPro: IPR001315), pirinski domen (InterPro: IPR004020), domen HEAT ponavljanja (InterPro: IPR004155), WD40 ponavljanje (InterPro: IPR001680), ponavljanje bogato leucinom (LRR) ili BIR ponavljanje (InterPro: IPR001370).[1]
NACHT domen se sastoji od sedam različitih konzerviranih motiva, uključujući P-petlju specifičnu za ATP/GTPazu, Mg2+-vezno mjesto (Walkeovir A i B motivi) i još pet specifičnih motiva. Jedinstvene karakteristike NACHT domena uključuju prevalenciju 'sićušnih' ostataka (glicin, [[alanin ili serin) direktno C-terminalnog aspartata koji koordinira Mg2+ u Walkerovom B motivu, umjesto drugog kiselog ostatka koji prevladava u drugim NTPazama. Drugi kiseli ostatak se tipski nalazi u proteinima koji sadrže dva NACHT položaja nizvodno. Nadalje, distalni motiv VII sadrži konzervirani obrazac polarnih, aromatskih i hidrofobnih ostataka koji se ne vidi ni u jednoj drugoj porodici NTPaza.[1]
Primjeri
Ljudski proteini koji sadrže ovaj domen uključuju::
- CIITA
- NAIP
- NLRC3, NLRC4, NLRC5
- NLRP1, NLRP2, NLRP3, NLRP4, NLRP5, NLRP6, NLRP7, NLRP8, NLRP9, NLRP10, NLRP11, NLRP12, NLRP13, NLRP14, NLRX1
- NOD1, NOD2
- NWD1
- TEP1
Reference
- ^ a b c Koonin EV, Aravind L (maj 2000). "The NACHT family - a new group of predicted NTPases implicated in apoptosis and MHC transcription activation". Trends in Biochemical Sciences. 25 (5): 223–4. doi:10.1016/S0968-0004(00)01577-2. PMID 10782090.
Vanjski linkovi
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
