PTOV1
| PTOV1 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | PTOV1 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM: 610195 MGI: 1933946 HomoloGene: 9687 GeneCards: PTOV1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 19: 49.85 – 49.86 Mb | Chr 7: 44.51 – 44.52 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Prekomjerno eksprimirani protein 1 tumora prostateje protein koji je kod ljudi kodiran genom PTOV1.[5][6][7]
Benedit et al. (2001.) utvrdili su da gen PTOV1 sadrži 12 egzona.[8]
Kloniranje i ekspresija
Koristeći diferencijalni prikaz za identifikaciju gena povećanih u tumorima prostate, praćene analizom baze podataka i RT-PCR, Benedit et al. (2001) klonirali su PTOV1. Izvedeni protein od 416 aminokiselina sastoji se gotovo u potpunosti od dva tandemski poredana bloka koja dijele 66% identiteta i pridruženi su kratkom veznom sekvencom. Predviđalo se da PTOV1 formira naizmjenične alfa-helikse i beta-listove. Northern blot analizom otkriven je transkript od 1,8 kb obilno izražen u mozgu, srcu, skeletnim mišićima, bubrezima i jetri. Normalna prostata eksprimira nizak nivo PTOV1. Western blot analizom tkiva tumora prostate otkriven je PTOV1 pri prividnoj molekulskoj masi od 58 kD. Imunocitohemijska analiza otkrila je endogeni PTOV1 u citoplazmi, koncentriran oko jedra.
Funkcija gena
Benedit et al. (2001.) otkrili su da je PTOV1 prekomjerno eksprimiran u devet ili 11 uzoraka tumora prostate. Bio je izrazito prekomjerno izražen u žarištima tumora prostate sa malignom morfologijom i bio je povišen umjeren, ali s homogenom raspodjelom, u morfološki normalnim ćelijama smještenim u benignim perifernim zonama istih tumora. U ćelijskoj liniji karcinoma prostate kod ljudi, ekspresija PTOV1 povećala se nakon izlaganja 5-alfa-dihidroksistestosteronu.
Imunohistokemijskom analizom, Santamaria et al. (2003.) otkrili su da je PTOV1 prekomjerno eksprimiran u 71% od 38 karcinoma prostate i u 80% uzoraka s intraepitelnom neoplazijom prostate. Visoki nivoi PTOV1 u tumorima značajno koreliraju sa proliferativnim indeksom i lokalizacijom PTOV1 u jedru. U mirno kultiviranim stanicama tumora prostate, PTOV1 se lokalizirao u citoplazmi i izuzeo se iz jedara. Nakon serumske stimulacije, PTOV1 se djelimično translocirao u jedto, na početku S faze. Na kraju mitoze, PTOV1 je izašao iz jedra. Privremena transfekcija PTOV1 fluorescentno označenog prisilnog ulaska ćelija u S-fazi i povećana ekspresija ciklina D1 (CCND1).
Santamaria i et al. (2005.) otkrili su da je PTOV1 stupio u interakciju s lipidnim prenosnim proteinom flotilinom-1 (FLOT1) u frakcijama nerastvorljivih u deterdžentu. Flotillin-1 se kolokalizirao s PTOV1 na plazmamembrani i u jedru, a ušao je u njega istovremeno s PTOV1, malo prije pokretanja S faze. Tokom ćelijskog ciklusa, razine proteina PTOV1 i flotilin-1 su oscilirale, sa vrhuncem u S-fazi. Iscrpljivanje PTOV1 značajno je inhibiralo jedarnu lokalizaciju flotilina-1, dok iscrpljivanje flotillina-1 nije na to uticalo. Iscrpljivanje bilo kojeg proteina izrazito je inhibiralo proliferaciju ćelija u baznim uvjetima. Prekomjerna ekspresija PTOV1 ili flotilin-1 snažno je inducirala proliferaciju, koja je zahtijevala njihovu lokalizaciju u jedru i ovisila je o recipročnom proteinu. Santamaria i et al. (2005.) zaključili su da PTOV1 pomaže flotilinu-1 u njegovoj translokaciji u jedru i da su oba proteina potrebna za proliferaciju ćelija.[9][10]
Aminokiselinska sekvenca
- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MVRPRRAPYR | SGAGGPLGGR | GRPPRPLVVR | AVRSRSWPAS | PRGPQPPRIR | ||||
| ARSAPPMEGA | RVFGALGPIG | PSSPGLTLGG | LAVSEHRLSN | KLLAWSGVLE | ||||
| WQEKRRPYSD | STAKLKRTLP | CQAYVNQGEN | LETDQWPQKL | IMQLIPQQLL | ||||
| TTLGPLFRNS | QLAQFHFTNR | DCDSLKGLCR | IMGNGFAGCM | LFPHISPCEV | ||||
| RVLMLLYSSK | KKIFMGLIPY | DQSGFVSAIR | QVITTRKQAV | GPGGVNSGPV | ||||
| QIVNNKFLAW | SGVMEWQEPR | PEPNSRSKRW | LPSHVYVNQG | EILRTEQWPR | ||||
| KLYMQLIPQQ | LLTTLVPLFR | NSRLVQFHFT | KDLETLKSLC | RIMDNGFAGC | ||||
| VHFSYKASCE | IRVLMLLYSS | EKKIFIGLIP | HDQGNFVNGI | RRVIANQQQV | ||||
| LQRNLEQEQQ | QRGMGG |
Reference
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104960 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000038502 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Santamaria A, Fernandez PL, Farre X, Benedit P, Reventos J, Morote J, Paciucci R, Thomson TM (Feb 2003). "PTOV-1, a novel protein overexpressed in prostate cancer, shuttles between the cytoplasm and the nucleus and promotes entry into the S phase of the cell division cycle". Am J Pathol. 162 (3): 897–905. doi:10.1016/S0002-9440(10)63885-0. PMC 1868092. PMID 12598323.
- ^ Santamaria A, Castellanos E, Gomez V, Benedit P, Renau-Piqueras J, Morote J, Reventos J, Thomson TM, Paciucci R (Feb 2005). "PTOV1 enables the nuclear translocation and mitogenic activity of flotillin-1, a major protein of lipid rafts". Mol Cell Biol. 25 (5): 1900–11. doi:10.1128/MCB.25.5.1900-1911.2005. PMC 549350. PMID 15713644.
- ^ "Entrez Gene: PTOV1 prostate tumor overexpressed gene 1".
- ^ Benedit, P., Paciucci, R., Thomson, T. M., Valeri, M., Nadal, M., Caceres, C., de Torres, I., Estivill, X., Lozano, J. J., Morote, J., Reventos, J. PTOV1, a novel protein overexpressed in prostate cancer containing a new class of protein homology blocks. Oncogene 20: 1455-1464, 2001. [PubMed]: 11313889
- ^ Santamaria, A., Castellanos, E., Gomez, V., Benedit, P., Renau-Piqueras, J., Morote, J., Reventos, J., Thomson, T. M., Paciucci, R. PTOV1 enables the nuclear translocation and mitogenic activity of flotillin-1, a major protein of lipid rafts. Molec. Cell. Biol. 25: 1900-1911, 2005. [PubMed]: 15713644
- ^ Santamaria, A., Fernandez, P. L., Farre, X., Benedit, P., Reventos, J., Morote, J., Paciucci, R., Thomson, T. M. PTOV-1, a novel protein overexpressed in prostate cancer, shuttles between the cytoplasm and the nucleus and promotes entry into the S phase of the cell division cycle. Am. J. Path. 162: 897-905, 2003. [PubMed]: 12598323
Dopunska literatura
- Benzinger A, Muster N, Koch HB, et al. (2005). "Targeted proteomic analysis of 14-3-3 sigma, a p53 effector commonly silenced in cancer". Mol. Cell. Proteomics. 4 (6): 785–95. doi:10.1074/mcp.M500021-MCP200. PMID 15778465.
- Mittler G, Stühler T, Santolin L, et al. (2004). "A novel docking site on Mediator is critical for activation by VP16 in mammalian cells". EMBO J. 22 (24): 6494–504. doi:10.1093/emboj/cdg619. PMC 291814. PMID 14657022.
- Clark HF, Gurney AL, Abaya E, et al. (2003). "The secreted protein discovery initiative (SPDI), a large-scale effort to identify novel human secreted and transmembrane proteins: a bioinformatics assessment". Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10.1101/gr.1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Benedit P, Paciucci R, Thomson TM, et al. (2001). "PTOV1, a novel protein overexpressed in prostate cancer containing a new class of protein homology blocks". Oncogene. 20 (12): 1455–64. doi:10.1038/sj.onc.1204233. PMID 11313889.
- Yu W, Andersson B, Worley KC, et al. (1997). "Large-scale concatenation cDNA sequencing". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10.1101/gr.7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, et al. (1996). "A "double adaptor" method for improved shotgun library construction". Anal. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474.
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
