Proser1
| Proser1 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | |||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | HomoloGene: 13463 GeneCards: [1] | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
| Ensembl |
| ||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) |
| ||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 3: 53.37 – 53.39 Mb | n/a | |||||||||||||||||||||||
| PubMed pretraga | [1] | n/a | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
PROSER1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom PROSER1 sa hromosoma 13.[2]
Nomenklatura
PROSER1 ima nekoliko alijasa: C13orf23, KIAA2032 i protein bogat prolinom i serinom 1.[3] [4]
Gen
Lokacija
PROSER1 nalazi se na negativnom (obrnutom) lancu hromosoma 13 na poziciji 13q13.3. Proteže se od 39,009.865 baznih parova od ptera do 39,038.095 bp od ptera, sa veličinom od 28.231 baze [5] U neprerfađenom primarnom traskriptu PROSER1 ima ukupno 13 egzona iRNK od 5,185 bp. Ima dvije izoforme, obje u rfasponu od 5.000 bp.[6]
Gensko susjedstvo
Geni STOML3 i NHLRC3 susedni su sa PROSER1 na hromosomu 13.[7]
Tkivna distribucija
Mapiranje ekspresije ekspresije PROSER1 pokazuje da ima posebno visoku ekspresiju u limfnom, embrionskom tkivu, timusu i maternici. Ima umjerenu ekspresiju u sjemenicima, larinksu, nervima, krvi i mjestima masnog tkiva.[8] Prema Atlasu ljudskih proteina, PROSER1 ima opću citoplazmatsku ekspresiju i eksprimiran je u svim kategorijama tkivne RNK.[9]
Homologija
Paralozi
PROSER1 nema paraloge.[10]
Ortolozi
PROSER1 je visoko konzerviran među sisarima. Manje je konzerviran, iako je pronađen kod riba, ptica i nekih beskičmenjaka. Ne eksprimira se u bakterijama, biljkama ili gljivama.[11] Prikaz ortologa u donjoj tabeli je prema NCBI-u.
| Rod i vrsta | Uobičajeno ime | Datiranje of divergencije (od H. sapiens) u milionima godina | Prostupni broj | Dužina proteinske sekvence (broj aminokiselina) | Identitet sekvence | Sličnost sekvence |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | Čovjek | – | NP_079414.3 | 944 | – | – |
| Gorilla gorilla | Gorila | 8,9 | XP_004054459 | 994 | 99% | 99% |
| Colobus angolensis palliatus | Angolski kolobus | 29,1 | XP_011798372 | 947 | 97% | 97% |
| Nannospalax galili | Spalaks | 90.9 MYA | XP_008847583 | 916 aa | 80% | 85% |
| Cricetulus griseus | Kineski hrčak | 90.9 MYA | XP_007626898 | 912 aa | 79% | 84% |
| Panthera tigris altaica | Sibirski tigar | 975 | XP_007097793 | 665 | 85% | 89% |
| Acinonyx jubatus | Gepard | 97,5 | XP_014926409 | 770 | 79% | 83% |
| Tursiops truncatus | Obični boconosi delfin | 975 | XP_004332367 | 1064 | 77% | 83% |
| Ornithorhynchus anatinus | Kljunar | 179,2 | XP_007666895 | 888 | 69% | 74% |
| Chelonia mydas | Zelena morska kornjača | 320,5 | XP_007070970 | 936 | 75% | 83% |
| Pygoscelis adeliae | Adeli pingvin | 320,5 | XP_009318201 | 938 | 75% | 83% |
| Calidris (philomachus) pugnax | Grgeč | 320,5 | XP_014821534 | 899 | 74% | 83% |
| Chrysemys picta bellii | Obojena kornjača | 320,5 | XP_008175998 | 825 | 73% | 82% |
| Aquila chrysaetos canadensis | Zlatni orao | 320,5 | XP_011579121 | 916 | 73% | 81% |
| Alligator sinensis | Kineski aligator | 320,5 | XP_014376376 | 940 | 72% | 81% |
| Gekko japonicus | Japanski gekon | 320,5 | XP_015281837 | 1053 | 65% | 75% |
| Python bivittatus | Mjanmarski piton | 320,5 | XP_007438154 | 924 | 65% | 75% |
| Anolis carolinensis | Karolinska anola | 320,5 | XP_008124125 | 920 | 64% | 75% |
| Xenopus tropicalis | Zapadna kanžasta žaba | 355,7 | XP_012813331 | 944 | 51% | 63% |
| Lepisosteus oculatus | Pjegava riba gar | 429,6 | XP_015197497 | 885 | 47% | 58% |
| Callorhinchus milii | Australijska duh-ajkula | 482,9 | XP_007889503 | 965 | 64% | 75% |
Protein
Opća svojstva
Prevedeni PROSER1 protein ima 944 aminokiseline. Njegova predviđena molekulska težina je 95,7 kdal.[12] PROSER1 ima izoelektričnu tački od 9[13], a nalazi se u jedru.[14]
Kompozicija
Sekvenca je bogata prolinom i serinom i nije posebno niska u bilo kojoj drugoj aminokiselini.
Domeni
PROSER1 sadrži jedan domen nepoznate funkcije, DUF 4476, dio pfam14771. DUF se proteže od 26 do 26 121 aminokiseline.[2] Molekulska težina DUF 4476 je 11,1 kdal.
aPROSER1 se sastoji prvenstveno od alfa-heliks, beta-listova i zavojnica. Protein je u velikoj mjeri umotan. DUF se sastoji uglavnom od alfa-heliksa i zavojnica. Ima nešto manje beta-listova u odnosu na protein u cjelini.[15]
Reference
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "GeneCards". Human Gene Database.
- ^ "BioCompare". BioCompare.
- ^ "Ensembl". Ensembl.
- ^ "GeneCards". Human Gene Database.
- ^ "NCBI Gene". NCBI.
- ^ "NCBI Gene". NCBI.
- ^ "Uniprot". Uniprot.
- ^ "Tissue Atlas". The Human Protein Atlas.
- ^ "Ensembl". Ensembl.
- ^ "Ensembl". Ensembl.
- ^ "Uniprot". Uniprot.
- ^ "Expasy". Expasy.
- ^ "PSORT II Prediction". PSORT II.
- ^ "SDSC Biology Workbench". SDSC.
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
