THADA
Tiroidnom adenomu pridruženi protein jest protein koji je kod ljudi kodiran genom THADA sa hromosoma 2.[5]
Amiokiselininska sekvenca
Dužina polipeptidnog lanca je 1.953 aminokiseline, a molekulska težina 219.607 Da.[6]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MGVKKKKEMQ | VAALTICHQD | LETLKSFADV | EGKNLASLLL | HCVQLTDGVS | ||||
| QIHYIKQIVP | LLEKADKNGM | CDPTIQSCLD | ILAGIYLSLS | LKNPLKKVLA | ||||
| SSLNSLPDFF | LPEAMHRFTS | RLQEELNTTD | LYSYRKVTDN | ISSCMENFNL | ||||
| GRASVNNLLK | NVLHFLQKSL | IEILEENRKC | AGNHIIQTQL | MNDLLVGIRV | ||||
| SMMLVQKVQD | FQGNLWKTSD | SPIWQNMCGL | LSIFTKVLSD | DDLLQTVQST | ||||
| SGLAIILFIK | TMFHPSEKIP | HLISSVLLRS | VDCTSVPEWF | MSSCRSLCCG | ||||
| DISQSAVLFL | CQGTLAMLDW | QNGSMGRSGE | ALLLDTAHVL | FTLSSQIKEP | ||||
| TLEMFLSRIL | ASWTNSAIQV | LESSSPSLTD | SLNGNSSIVG | RLLEYVYTHW | ||||
| EHPLDALRHQ | TKIMFKNLLQ | MHRLTVEGAD | FVPDPFFVEL | TESLLRLEWH | ||||
| IKGKYTCLGC | LVECIGVEHI | LAIDKTIPSQ | ILEVMGDQSL | VPYASDLLET | ||||
| MFRNHKSHLK | SQTAESSWID | QWHETWVSPL | LFILCEGNLD | QKSYVIDYYL | ||||
| PKLLSYSPES | LQYMVKILQT | SIDAKTGQEQ | SFPSLGSCNS | RGALGALMAC | ||||
| LRIARAHGHL | QSATDTWENL | VSDARIKQGL | IHQHCQVRID | TLGLLCESNR | ||||
| STEIVSMEEM | QWIQFFITYN | LNSQSPGVRQ | QICSLLKKLF | CRIQESSQVL | ||||
| YKLEQSKSKR | EPENELTKQH | PSVSLQQYKN | FMSSICNSLF | EALFPGSSYS | ||||
| TRFSALTILG | SIAEVFHVPE | GRIYTVYQLS | HDIDVGRFQT | LMECFTSTFE | ||||
| DVKILAFDLL | MKLSKTAVHF | QDSGKLQGLF | QAALELSTST | KPYDCVTASY | ||||
| LLNFLIWQDA | LPSSLSAYLT | QQVACDNGDR | PAAVVERNTL | MVIKCLMENL | ||||
| EEEVSQAENS | LLQAAAAFPM | YGRVHCITGA | LQKLSLNSLQ | LVSEWRPVVE | ||||
| KLLLMSYRLS | TVVSPVIQSS | SPEGLIPMDT | DSESASRLQM | ILNEIQPRDT | ||||
| NDYFNQAKIL | KEHDSFDMKD | LNASVVNIDT | STEIKGKEVK | TCDVTAQMVL | ||||
| VCCWRSMKEV | ALLLGMLCQL | LPMQPVPESS | DGLLTVEQVK | EIGDYFKQHL | ||||
| LQSRHRGAFE | LAYTGFVKLT | EVLNRCPNVS | LQKLPEQWLW | SVLEEIKCSD | ||||
| PSSKLCATRR | SAGIPFYIQA | LLASEPKKGR | MDLLKITMKE | LISLAGPTDD | ||||
| IQSTVPQVHA | LNILRALFRD | TRLGENIIPY | VADGAKAAIL | GFTSPVWAVR | ||||
| NSSTLLFSAL | ITRIFGVKRA | KDEHSKTNRM | TGREFFSRFP | ELYPFLLKQL | ||||
| ETVANTVDSD | MGEPNRHPSM | FLLLLVLERL | YASPMDGTSS | ALSMGPFVPF | ||||
| IMRCGHSPVY | HSREMAARAL | VPFVMIDHIP | NTIRTLLSTL | PSCTDQCFRQ | ||||
| NHIHGTLLQV | FHLLQAYSDS | KHGTNSDFQH | ELTDITVCTK | AKLWLAKRQN | ||||
| PCLVTRAVYI | DILFLLTCCL | NRSAKDNQPV | LESLGFWEEV | RGIISGSELI | ||||
| TGFPWAFKVP | GLPQYLQSLT | RLAIAAVWAA | AAKSGERETN | VPISFSQLLE | ||||
| SAFPEVRSLT | LEALLEKFLA | AASGLGEKGV | PPLLCNMGEK | FLLLAMKENH | ||||
| PECFCKILKI | LHCMDPGEWL | PQTEHCVHLT | PKEFLIWTMD | IASNERSEIQ | ||||
| SVALRLASKV | ISHHMQTCVE | NRELIAAELK | QWVQLVILSC | EDHLPTESRL | ||||
| AVVEVLTSTT | PLFLTNPHPI | LELQDTLALW | KCVLTLLQSE | EQAVRDAATE | ||||
| TVTTAMSQEN | TCQSTEFAFC | QVDASIALAL | ALAVLCDLLQ | QWDQLAPGLP | ||||
| ILLGWLLGES | DDLVACVESM | HQVEEDYLFE | KAEVNFWAET | LIFVKYLCKH | ||||
| LFCLLSKSGW | RPPSPEMLCH | LQRMVSEQCH | LLSQFFRELP | PAAEFVKTVE | ||||
| FTRLRIQEER | TLACLRLLAF | LEGKEGEDTL | VLSVWDSYAE | SRQLTLPRTE | ||||
| AAC |
Funkcija
Kako bi identificirali genetičke faktore koji se odnose na podložnost raku štitnjače, u jednoj studiji iz 2009., usvojili su pristup gena kandidata. Proučavali su označene i pretpostavljene funkcionalne jednonukleotidne polimorfizme (SNP) u genima uključenim u diferencijaciju i proliferaciju ćelija štitnjače, te u genima za koje je utvrđeno da su različito eksprimirani u karcinomu štitnjače.
Genotipizirano je ukupno 768 SNP-ova u 97 gena u španskoj seriji od 615 slučajeva i 525 kontrola, od kojih je prva činila najveću kolekciju pacijenata sa ovom patologijom iz jedne populacije koja je proučavana do sada. SNP-ovi u LD bloku, koji obuhvata cijeli gen FOXE1, pokazali su najjači dokaz povezanosti s osjetljivošću na papilni karcinom štitnjače. Ova povezanost potvrđena je u drugoj fazi studije koja je uključivala nezavisnu italijansku seriju od 482 pacijenta i 532 kontrolne skupine. Najjači rezultati asocijacije uočeni su za rs1867277: OR[po-alelu] = 1,49; 95%CI = 1,30 –1,70; P = 5,9x10 (x –9). Funkcionalni testovi rs1867277 (NM_004473.3:c.-283G>A) u okviru FOXE1 5' UTR sugeriraju da ova varijanta transkripta utiče na transkripciju FOXE1. Testovi vezanja DNK pokazali su da je, isključivo, sekvenca koja sadrži alel A regrutovala faktore transkripcije USF1/USF2, dok su oba alela formirala kompleks u kojem su učestvovali DREAM/CREB/alphaCREM.
Studije transfekcije pokazale su alelno zavisnu regulaciju transkripcije FOXE1. Predlažen je model regulacije FOXE1 koji ovisi o genotipu rs1867277, što ukazuje da je ovaj SNP uzročna varijanta u osjetljivosti na rak štitnjače. Ti rezultati predstavljali su prvo funkcionalno objašnjenje za povezanost koju je identificirala analiza cjelokupnog genoma (GWAS) i na taj način razjašnjavaju mehanizam podložnosti karcinomu štitnjače. Oni također potvrđuju efikasnost pristupa gena kandidata u GWAS eri.[7]
Reference
- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000115970 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024251 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Entrez Gene: Thyroid adenoma associated". Pristupljeno 10. 6. 2013.
- ^ "UniProt, Q6YHU6" (jezik: engleski). Pristupljeno 15. 11. 2021.
- ^ Iñigo Landa, Sergio Ruiz-Llorente, Cristina Montero-Conde, Lucía Inglada-Pérez, Francesca Schiavi, Susanna Leskelä, Guillermo Pita, Roger Milne, Javier Maravall, Ignacio Ramos, Víctor Andía, Paloma Rodríguez-Poyo, Antonino Jara-Albarrán, Amparo Meoro, Cristina del Peso, Luis Arribas, Pedro Iglesias, Javier Caballero, Joaquín Serrano, Antonio Picó, Francisco Pomares, Gabriel Giménez, Pedro López-Mondéjar, Roberto Castello, Isabella Merante-Boschin, Maria-Rosa Pelizzo, Didac Mauricio, Giuseppe Opocher, Cristina Rodríguez-Antona, Anna González-Neira, Xavier Matías-Guiu, Pilar Santisteban, Mercedes Robledo (2009): The variant rs1867277 in FOXE1 gene confers thyroid cancer susceptibility through the recruitment of USF1/USF2 transcription factors. PLoS Genet, 5(9):e1000637; pmid: 19730683; pmcid: pmc2727793; doi: 10.1371/journal.pgen.1000637
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
