Søby Værft er et fondsejet skibsværft beliggende i Søby på Ærø, blev grundlagt i 1931 som motorværksted af Arthur Christian Jørgensen (1908-1994), og har gennem årene udviklet sig til at være et reparations- og nybygningsværft med 3 tørdokke.
Værftet har omkring 150 mand beskæftiget (2019), heraf er de 75 egne ansatte og de øvrige i blandt andre de lokale Nautic Wood og Søby Skibselektro. Søby Værft bygger bl.a. orlogsfartøjer til Søværnet. Værftets hovedaktivitet er reparationer, vedligeholdelse og installationer af skibsmotorer, samt nybygning, ombygning, retrofitting og reparation af skibe. Værftet leverer herudover stålkonstruktioner til skibe og til offshore industrien, og udfører endvidere rejsearbejde indenfor motoroverhalinger, rørarbejder med mere. Motorafdelingen er specialiseret i reparation af alle motortyper og propellerfremdriftssystemer.
Værftets historie
Arthur Jørgensen etablerer 1931 i Søby et værksted, der specialiserer sig i reparation og forbedring af mindre skibsmotorer. Produktionen af skibsmotorer indledes 1937 med 6 stk. benzin-og 4 stk. råoliemotorer, og den første bedding indvies 1941. 1950 starter stålskibsreparationsafdelingen og bådeværftet. Der bygges fiskerbåde af træ, og ca. 30 mand er beskæftiget.
2006: Ny kontrakt med Søværnet om bygning af yderligere 5 orlogsfartøjer af 900 klassen.
2012: M/F Faaborg III og M/F Agersø III.
2013: Nautic Wood overtager værftets snedker/tømrerafdelingen på Søby Værft.
2017: Hybridfærgen M/F Kanalen. Skrog og overbygning er lavet hos en underleverandør.
2018: Elfærgen Ellen. Skrog og overbygning er bygget hos en underleverandør i Stettin i Polen, mens værftet står for aptering, efterfulgt af en testsejlads med Søfartsstyrelsen. - Tre norske 15 meter sterntrawlere, Bratholm, Galant og Boie
2019: Værftet har indgået to-årig kontrakt med Slagelse og Kalundborg kommuner om at vedligeholde deres ø-færger.