Η πρωταθλήτρια της ΕΠΣ Χαλκιδικής έχει τη δυνατότητα να κερδίσει την άνοδο στη Γ΄ Εθνική ερασιτεχνική κατηγορία, ενώ η ομάδα που ανακηρύσσεται κυπελλούχος ΕΠΣ Χαλκιδικής, αποκτά το δικαίωμα συμμετοχής στο Κύπελλο Ελλάδας.
Η δομή του πρωταθλήματος της Ε.Π.Σ. Χαλκιδικής είναι η εξής:[1]
Α΄ Κατηγορία
Β΄ Κατηγορία
Βόρειος Όμιλος
Νότιος Όμιλος
Γ΄ Κατηγορία
Αναδιάρθρωση
Τον Μάιο του 2018 η ΕΠΣΧ αποφάσισε την αναδιάρθρωση των κατηγοριών του πρωταθλήματος.[2] Έτσι από την περίοδο 2019-20 η δομή του πρωταθλήματος θα είναι ως εξής:
Α1 Κατηγορία: η κορυφαία κατηγορία θα ονομάζεται Α1 και θα απαρτίζεται από 12 ομάδες, 10 από την Α ΕΠΣΧ 2018-19 (2η-11η θέση) και 2 από την Β ΕΠΣΧ (πρωταθλήτριες των δυο ομίλων)
Α Κατηγορία: η 2η κατηγορία θα είναι η Α΄ όπου θα συμμετέχουν επίσης 12 σύλλογοι , 5 θα προέρχονται από την Α ΕΠΣΧ 2018-19 (θέσεις 12-16) , 6 από την Β΄ (θέσεις 2η-4η από κάθε όμιλο) και η πρωταθλήτρια της Γ κατηγορίας.
Β Κατηγορία: η 3η κατηγορία (Β΄) θα διεξάγεται σε ομίλους ανάλογα με τον αριθμό συμμετοχών. Στην κατηγορία αυτή θα αγωνιστούν 20 ομάδες της Β ΕΠΣΧ 2018-19 (θέσεις 5-14 σε κάθε όμιλο) , οι ομάδες της Γ εκτός της πρωταθλήτριας , καθώς και όποιες επαναδραστηριοποιηθούν η εγγραφούν στην ΕΠΣΧ.
Α΄ Κατηγορία
Η κορυφαία κατηγορία της ΕΠΣ Χαλκιδικής διεξάγεται με τη συμμετοχή 16 ομάδων και με τη μορφή πρωταθλήματος διπλών αγώνων. Πρωταθλήτρια για την περίοδο 2018-19 ήταν ο Νέος Π.Ο. Νέας Καλλικράτειας. Δεν διοργανώθηκαν Play Off για την ανάδειξη πρωταθλητή καθώς η βαθμολογική διαφορά με το 2ο στην κανονική περίοδο ήταν μεγαλύτερη των 7 βαθμών.[1]