En 1992 participó en la fundación del Grupo de Estudio de Lenguas Amenazadas para el conocimiento y estudio de la diversidad lingüística. Formó parte del comité de expertos que se consultaron para redactar la Declaración Universal de los Derechos Lingüísticos (1996) y fue miembro del Comité Científico Internacional de Linguamón - Casa de las Lenguas . Fundó, junto a otros colaboradores, la Revista de Igualada, de la que fue miembro del consejo de redacción desde 1999.
Dirigió el proyecto del inventario de lenguas que se hablan en Cataluña, que actualmente ya supera las 300.[8] Ha sido comisaria de las exposiciones "Las lenguas en Cataluña" [9] y "Las lenguas de los catalanes" para difundir el trabajo del inventario. También participó en diferentes debates, como la gestión de las lenguas en una posible Cataluña independiente: en este ámbito, Junyent defiende que no debería haber lenguas oficiales puestos que, según ella, las lenguas oficiales no necesitan la oficialidad y a las lenguas subordinadas no les sirve de nada.[10]
En 2010 organizó la jornada Visibilizar o marcar: repensar el género en la lengua catalana,[11] de la que se publicaron las actas en 2013.[12] A partir de esta jornada, se consensuó un documento cuyo punto clave es el reconocimiento del género no marcado o masculino como inclusivo del marcado o femenino, y garantiza, por tanto, que ningún organismo puede obligar a escribir documentos con formas desdobladas (niños y niñas, catalanes y catalanas, etc.). Posteriormente, publicó algunos artículos divulgativos sobre esta misma cuestión. Trabajó como profesora de lingüística general en la Facultad de Filología y Comunicación de la Universidad de Barcelona .
En 2019 fue galardonada con la Creu de Sant Jordi "por su larga trayectoria en el estudio y la defensa de la diversidad lingüística en Cataluña y en el mundo".[13]
1992, Vida i mort de les llengües. Barcelona: Empúries.
1993, Las lenguas del mundo. Una introducción. Barcelona: Octaedro.
1996, Estudis africans. Barcelona: Empúries.
1998, Contra la planificació. Una proposta ecolingüística. Barcelona: Empúries.
1998, La expansión bantú. Cuadernos Monográficos. Madrid: Asociación Española de Africanistas.
1999, La diversidad lingüística. Guía didáctica y recorrido por las lenguas del mundo. Barcelona: Octaedro.
2000, Quadern E.S.O. de La diversitat lingüística. Barcelona: Octaedro.
2000, Guía didàctica del Quadern E.S.O. de La diversitat lingüística. Barcelona: Octaedro.
2000 Lingüística històrica. Text-guia. Barcelona: Publicacions de la Universitat de Barcelona.
2000, Antropologia lingüística. Text-guia. Barcelona: Publicacions de la Universitat de Barcelon.
2002, La Gimcana de les Llengües. Barcelona: Octaedro.
2016, Escoles a la frontera. Vic: Eumo.
2002, M. C. Junyent; V. Unamuno (ed.) El català: Mirades al futur. Barcelona: EUB-Octaedro, ISBN84-8312-039-9.
2005, M. C. Junyent (ed.). Les llengües a Catalunya. Barcelona: Octaedro.
2005, M. C. Junyent; F. Marti; P. Ortega; A. Barrena; I. Idiazabal; P. Juaristi; B. Uranga; E. Amorrortu (ed.). Words and Worlds: World Languages Review. Clevedon: Multilingual Matters.
2009, M. C. Junyent; M. Barrieras, M; P. Comellas; M. Fidalgo; V. Unamuno. La diversitat lingüística a l’aula: Construir centres educatius plurilingües. Barcelona: Fundació Jaume Bofill.
2009, M. C. Junyent (ed.). Llengua i acollida. Barcelona: Horsori.
2009, M. C. Junyent (ed.). Transferències: La manifestació dels processos extralingüístics en les llengües del món = Transferences: The expression of extra-linguistic processes in the world's languages. Vic: EUMO.
2010, M. C. Junyent; C. Muncunill, C. El libro de las lenguas, Barcelona: Octaedro.
2012, M. C. Junyent. El rol de les llengües dels alumnes a l'escola. Barcelona: Horsori.
2013, M. C. Junyent (ed.). Visibilitzar o marcar: Repensar el gènere en la llengua catalana. Barcelona: Empúries.
2014, M. C. Junyent; P. Comellas; M. Cortès-Colomé; M. Barrieras; E. Monrós; M. Fidalgo. Què hem de fer amb les llengües dels alumnes a l'escola?: un estudi de representacions lingüístiques a l'Anoia. Barcelona: Horsori.
2014, M. C. Junyent; P. Comellas; M. Cortès-Colomé; M. Barrieras; E. Monrós; M. Fidalgo. La diversidad lingüistica: una invitación a reconocerla, comprenderla e incorporarla. Barcelona: Horsori.