Eestimaal kuulusid perekond Clodt von Jürgensburgidele Valkla (Wallküll), Kloodi (Peuth), Rannamõisa (Vogelsang), Tõdva-Kõnnu (Köndes), Korjodi (Korjoth), Oru (Orrenhof), Auaste (Wiesenau), Vasta (Waschel), Humala (Hummala), Edara (Eddara), Saha (Saage) ja Samma (Samm) mõis. Suguvõsanime andnud Jürgensburgi mõis müüdi 1780. aastal ning mõisa endised omanikud ja suguvõsa esindajad kolisid Venemaa sisekubermangudesse, säilitades ainult nimeliidese von Jürgensburg.
Vabahärra Johann Adolf Clodt von Jürgensburg (1658–1720), Rootsi jalaväekindralleitnant, poliitik, Eestimaa rüütelkonna peamees 1694–1696, Riia komandant 1709 ja Rootsi vabahärra aastast 1714, kes langes vangi Põhjasõjas ja suri Moskvas (rootsi wiki Johan Adolph Clodt)