Il est directeur des Archives de Physiologie normale et pathologique (1880-1889) et l'un des fondateurs des Archives de médecine expérimentale.
Il est élu membre titulaire de l'Académie nationale de médecine le [1], secrétaire de la Société de Biologie, membre de la Société d'Anatomie, chevalier de la Légion d'honneur.
Œuvres et publications
De la pachyméningite cervicale hypertrophique (d'origine spontanée), Delahaye (Paris), 1873, Texte intégral.
De la médication par l'alcool, Delahaye (Paris), 1875.
De l'influence des excitations cutanées sur la circulation et la calorification, [Thèse présentée au concours de l'agrégation], Parent (Paris), 1878, Texte intégral.
Exposé des titres scientifiques, G. Masson (Paris), 1884, Texte intégral.
« Sur un cas d’aphasie sensorielle avec lésion temporo-pariétale droite », in: Revue Neurologique, 16 (1903): 112-115.
Des rapports de la syphilis et de la paralysie générale, impr. de J. Gainche (Paris), 1905, 23 p. in-8, lire en ligne sur Gallica.
Jean-Martin Charcot [1825-1893], Chameret et Renouard, 32 p.
En collaboration
avec Jean-Martin Charcot: Deux cas d'atrophie musculaire progressive: avec lésions de la substance grise et des faisceaux antérolatéraux de la moelle épinière, Masson (Paris), 1869.
avec Jacques Roubinovitch: Des variétés cliniques de la folie en France et en Allemagne, O. Doin (Paris), 1896.
avec Roger Dupouy: Fugues et vagabondage; étude clinique et psychologique, Alcan (Paris), 1909.
avec Roger Mignot, (1874-1947): La paralysie générale, O. Doin et fils, 1910.
Denis Tiberghien: Entre Ball et Ballet, Alix Joffroy (1844-1908), sa vie, ses travaux, [Thèse de doctorat en médecine de la Faculté de Lille], 1995..
Denis Tiberghien: « Alix Joffroy (1844-1908), titulaire de la chaire des maladies mentales et de l'encéphale de 1893 à 1908, vu par Jean-Martin Charcot », in: Annales médico-psychologiques, 2006, vol. 164, no8, pp. 650–658.
(en) Denis Tiberghien, « A pioneer in neuropathology: Alix Joffroy (1844-1908), J.-M Charcot's pupil. », Neuromuscul Disord, vol. 20, no 3, , p. 207-13.
(en) Julien Bogousslavsky (direction): Following Charcot: a forgotten history of neurology and psychiatry, Karger Medical and Scientific Publishers (Basel), 2011.
(en) Denis Tiberghien: « The letters of Alix Joffroy (1844–1908), a medical intern at Lariboisière’s Hospital at the time of the Commune of Paris », in: J Med Biogr, March 21, 2014.
