140 prisonniers de guerre de la Seconde Guerre mondiale, morts en captivité, sont enterrés dans ce cimetière, ainsi que 4 officiers de la Royal Air Force britannique de la Seconde Guerre mondiale. Il y a également la tombe de 27 Buffalo Soldiers qui ont servi pendant les guerres indiennes.
Bien que le poste militaire de la région ait été établi en 1875 et que la construction du Fort Sam Houston ait commencé l'année suivante, aucun enterrement n'a eu lieu dans la zone qui constitue actuellement le cimetière jusqu'en 1926. En 1931, 60 acres (24 ha) ont été ajoutés au cimetière national de San Antonio. En 1937, l'ajout est devenu un cimetière national à part entière, rebaptisé Fort Sam Houston National Cemetery. En 1947, plusieurs autres forts du Texas, dont Fort McIntosh, ont été fermés et leurs cimetières ont été transférés au cimetière national de Fort Sam Houston.
Au cimetière national de Fort Sam Houston sont enterrés 140 prisonniers de guerre de l'Axe de la Seconde Guerre mondiale qui sont morts en captivité. 133 sont allemands, 4 sont italiens et 3 sont japonais. Ces prisonniers de guerre ont été désincarcérés de divers camps de prisonniers de guerre du Texas et réinhumés au cimetière national de Fort Sam Houston. Parmi ces prisonniers de guerre se trouve Hugo Krauss, un Allemand assassiné par d'autres prisonniers de guerre allemands au camp Hearne en 1943. Lors de l'inhumation initiale, ces tombes étaient isolées des tombes américaines.
Deux pierres tombales marquées de croix gammées (swastika) ont été remplacées le 24 décembre 2020. La Military Religious Freedom Foundation avait demandé leur enlèvement en mai 2020, mais la Veterans Administration (VA) s'y est opposée au motif qu'elles étaient historiques. L'administration des vétérans a résisté jusqu'à ce que le sénateur Ted Cruz (R-TX) et les membres du Congrès Will Hurd (R-TX23) et Kay Granger (R-TX12) fassent pression sur eux[1],[2].
Général Richard E. Cavazos, premier général quatre étoiles hispanique de l'armée des États-Unis.
Lieutenant-colonel Granville C. Coggs, éminent médecin américain, officier de réserve de l'armée de l'air américaine/de l'armée de l'air américaine/de l'armée de l'air américaine, et pilote bombardier entraîné au sein des célèbres Tuskegee Airmen ou "Red Tails" (queues rouges). Premier Afro-Américain à occuper un poste de médecin à l'hôpital Kaiser de San Francisco, Californie.
