Il s'est intéressé particulièrement aux questions concernant la notion d'espèce et à la caractérisation des niveaux inférieurs (entre espèce et variété), caractérisations partiellement non reconnues par le code de la botanique, ainsi qu'aux questions des hybrides. Il est en particulier le créateur de la notion de forme et de sous-variété[2]. Son énorme et minutieuse production, en raison de son caractère non conforme à la norme botanique, n'a pas connu la diffusion d'autres auteurs plus conformistes[3].
Il a été vice-président de la Société botanique de France, directeur de l'Académie internationale de géographie botanique.
Quelques publications
Excursions botaniques en Espagne : Herborisations aux environs de Jativa en et .- Bull. Soc. bot. Fr., 1881, 1882
Matériaux pour servir à la révision de la flore portugaise accompagnés de notes sur certaines espèces ou variétés critiques de plantes européennes - A. Hérissey, imp., 1882
Excursions botaniques en Espagne en 1881 et 1882.- Revue des Sciences Naturelles Soc. Lang. Géo. Montp., hors série, 1883
Illustrationes plantarum Europae rariorum : Diagnoses des plantes rares ou rarissimes de la flore européenne accompagnées de planches représentant toutes les espèces décrites - Paris : Les Fils d'Émile Deyrolle, 1895-1899[5]
Avec Edmond Gustave Camus, Xavier Constant Chatenier, Julien Foucaud - Flore de France ou description des plantes qui croissent spontanément en France, en Corse et en Alsace-Lorraine - 14 tomes de 1893 à 1913, - Paris : Paul Lechevalier éditeur Numérisé sur Télabotanica
Les contes fantastiques de M. Malinvaud - Article polémique paru en 1905
avec une biographie de Georges Rouy par Paul-Henri Lecomte - Conspectus de la « Flore de France », ou Catalogue général des espèces, sous-espèces, races, variétés, sous-variétés et formes hybrides contenues dans la « Flore de France » - Paris : Paul Lechevalier éditeur, 1927 Numérisé à la bibliothèque digitale du Real Jardin Botánico
Plantes qui lui ont été dédiées
Un genre Rouya Coincy de la famille des Apiacées ainsi que les plantes suivantes lui ont été dédiés :
↑Jean-Jacques Amigo, « Rouy (Claude, Charles, Georges) », dans Nouveau Dictionnaire de biographies roussillonnaises, vol. 3 Sciences de la Vie et de la Terre, Perpignan, Publications de l'olivier, , 915 p. (ISBN9782908866506)
Jean-Jacques Amigo, « Rouy (Claude, Charles, Georges) », dans Nouveau Dictionnaire de biographies roussillonnaises, vol. 3 Sciences de la Vie et de la Terre, Perpignan, Publications de l'olivier, , 915 p. (ISBN9782908866506)
Julia Baranda - Georges Rouy (1851-1924), Su obra botánica en España - Madrid : Monografías del real jardín botánico, 1984