Il réalise sa première patrouille, quittant le port de Kiel, le , sous les ordres du KapitänleutnantKurt Dobratz et rejoint quatre jours plus tard le port de Horten. Le , l'U-1232 reprend la mer pour traverser l'Atlantique Nord, et patrouiller le long des côtes canadiennes.
Le , après avoir coulé trois navires du convoi BX 141 (Boston-Halifax) juste à côté d'Halifax en Nouvelle-Écosse, l'U-1232 est contre-attaqué par les escortes du convoi. La frégate canadienne NCSM Ettrick éperonne l'U-Boot, causant d'importants dégâts au kiosque, aux périscopes et au mât de radio. Par la suite, il est attaqué par des charges de profondeur, mais il réussit à s'éclipser. En raison de ces dommages, l'U-1232 abandonne sa patrouille et se dirige vers sa base, arrivant à Marviken en Norvège le .
Mis hors service en à Wesermünde en Allemagne, l'U-1232 est capturé par les Britanniques en . Le sous-marin sombre le à la position géographique de 54° 11′ 02″ N, 7° 24′ 07″ E alors qu'il est en remorquage.
L'U-1232 a coulé quatre navires ennemis pour un total de 24 531 tonneaux et endommagé un navire de 2 373 tonneaux au cours de l'unique patrouille de guerre (97 jours en mer) qu'il effectua.
Chris Bishop, historien militaire (trad. de l'anglais par Christian Muguet), Les sous-marins de la Kriegsmarine : 1939-1945 : le guide d'identification des sous-marins [« The spellmount submarine identification guide : Kriegsmarine U-boats 1939-1945 »], Paris, Éd. de Lodi, , 192 p. (ISBN978-2-84690-327-1, OCLC470721805, BNF41298980)