Terminato il percorso universitario, nel 2021 Bajraktarević è stato acquistato dal N.E. Revolution che lo ha assegnato alla seconda squadra. Ha debuttato il 9 settembre nell'incontro di USL League One pareggiato 1-1 contro il S.G. Tormenta[3] e tre giorni più tardi ha segnato il suo primo gol contro il Carolina RailHawks.[4] Il 19 novembre ha firmato un contratto professionistico con la seconda squadra.[5]
Il 23 maggio 2022 ha firmato fino al 2025 con la prima squadra[6] e tre giorni dopo ha debuttato nell'incontro di Lamar Hunt U.S. Open Cup perso 1-0 contro il New York City.[7] Il 18 agosto ha esordito anche in MLS contro il Toronto FC.[8] Ha segnato il suo primo gol l'8 agosto 2023 nell'incontro di Leagues Cup perso ai rigori contro il Querétaro.[9]
Il 2 gennaio 2025 viene acquistato a titolo definitivo dal PSV.[10][11]
Nazionale
Nel 2022 ha debuttato con la nazionale statunitense Under-17.[12] L'8 ottobre 2023 ha ricevuto la prima convocazione con la nazionale olimpica per disputare due incontri con Messico e Giappone.[13]
Successivamente ha optato per rappresentare la Bosnia ed Erzegovina, nazionale delle sue origini,[17] da cui è stato chiamato per la prima volta nell'agosto 2024.[18] Ha esordito il 7 settembre 2024 nella partita contro i Paesi Bassi valida per l'UEFA Nations League (persa 5-2), fornendo anche un assist.[19] Il 14 ottobre seguente è partito per la prima volta da titolare nella sfida persa in casa in UEFA Nations League contro l'Ungheria (0-2).[20][21]
