3. divisjon fotball for menn 1990 var det tredje øverste nivået i norsk fotball og det siste året nivå tre var kjent som «3. divisjon». Divisjonen besto av 72 lag fordelt geografisk på seks avdelinger.
Dette var første sesong klubbenes andrelag kunne delta i seriesystemet[1], men ingen av disse spilte høyere enn 4. divisjon.
Opp- og nedrykk
Ett lag fra hver avdeling rykket opp til den nye 1. divisjon. De tre siste lagene i hver avdeling og de fire siste i avdeling F, totalt 19 lag, rykket ned til den nye 3. divisjon.