FA Premier League 1999–2000 var den åttende sesongen av FA Premier League. Manchester United vant Premier League[1] for sjette gang og for andre sesong på rad. Dette var klubbens 13. ligatittel totalt.
De tre dårligste klubbene i Premier League rykket automatisk ned til 1. divisjon og de to beste klubbene i 1. divisjon rykket automatisk opp til Premier League. Play-off ble spilt der klubbene som kom på tredje, fjerde, femte og sjetteplass i 1. divisjon spilte om en plass i Premier League.