Ca atare, Ioana era arhiducesă a Austriei, infantă de Castilia și Aragon, prințesă de Burgundia și de Flandra, fiica unui împărat roman.
S-a căsătorit cu vărul ei primar, infantele João Manuel al Portugaliei, care era moștenitorul tronului portughez, singurul supraviețuitor pe linie masculină al mătușii sale paterne Caterina de Habsburg și al unchiului ei matern, regele Ioan al III-lea al Portugaliei. Singurul lor copil, Sebastian al Portugaliei, s-a născut în 1554 când mama sa avea 19 ani și la două săptămâni după ce tatăl său în vârstă de 17 ani a murit de diabet.
La scurt timp după nașterea lui Sebastian, Ioana a fost chemată la Madrid de fratele ei, regele Filip al II-lea al Spaniei, pentru a conduce țara în timp ce el se afla în Anglia pentru a se căsători cu regina Maria I a Angliei. Fiind inteligentă și eficientă, Ioana a jucat admirabil acest rol.
Ea nu s-a recăsătorit și nu a revenit în Portugalia pentru a-l revedea pe fiul ei, Sebastian, deși îi întreținea corespondență cu el și păstra portretele lui pictate la diferite vârste. A fost singura membră a Ordinului iezuit.
Generațiile indică descendența de la Carol Quintul, sub care coroanele Castiliei și Aragonului s-au unit formând regatul Spaniei. Anterior, titlul de Infantă era folosit în diferite regate.
Elisabeta Marie, Prințesă de Windisch-Graetz •Helena, Ducesă Philipp de Württemberg** •Rosa, Ducesă de Württemberg** • Arhiducesa Dolores** • Maria Inmaculada, Nobile Inigo Neri Sereneri** • Margarita, Marchiză Taliani di Marchio** • Prințesă Maria Antonia, Mrs. Luis Pérez** • Arhiducesa Assunta, Mrs. Joseph Hopfinger** • Elisabeta, Contesă de Waldburg-Zeil** • Hedwig, Contesă de Stolberg-Stolberg** • Gertrud, Contesă de Waldburg-Zeil-Trauchburg** • Arhiducesa Maria Elisabeta** • Arhiducesa Agnes** • Arhiducesa Margarethe, Mrs. Alexander Cech •Ilona, Ducesă de Mecklenburg • Arhiducesa Anna Theresia • Arhiducesa Maria Kynga, Mrs. Joachim Krist
Generație 17
Arhiducesa Adelheid •Charlotte, Ducesă de Mecklenburg •Elisabeta, Prințesă Heinrich de Liechtenstein • Elisabeta, Edle Hubert von Braun** • Alice, BaronesăVittorio Manno** • Marie Antoinette, Baronesăde Prdef in Irnich** • Arhiducesa Marie Christine** • Arhiducesa Walburga, Mrs. Carlos Tasso** • Arhiducesa Verena** • Arhiducesa Katharina, Mrs. Roland Huber** • Agnes, BaronesăPeter de Fürstenberg** • Maria Ileana, Contesă Adam Kottulinski** • Alexandra, BaronesăViktor de Baillou** • Maria Magdalena, Baronesăde Holzhausen** • Arhiducesa Elisabeta, Mrs. Friedrich Sandhdeer** •Agnes, Prințesă Karl Alfred de Liechtenstein** • Arhiducesa Maria Margaretha** • Arhiducesa Ludovica** • Arhiducesa Allix** • Josepha, Contesă Clemens de Waldstein-Wartenberg** •Valerie, Margravine de Baden** • Alberta, BaronesăAlexander de Kottwitz-Erdödy** •Theresa, Prințesă Rasso de Bavaria** • Maria Inmakulata, Contesă Reinhart de Hoensbroech** • Arhiducesa Monika, Mrs. Charles de Rambures • Arhiducesa Marie Christine, Mrs. Raymond van der Meide • Arhiducesa Maria, Mrs. Wilhelm de Witt • Margherita, Contesă Benedikt de Piatti
Generație 18
Andrea, Contesă de Neipperg •Monica, Ducesă de Maqueda •Michaela, Contesă Hubertus de Kageneck •Arhiducesa Gabriela, Mrs. Christian Meister •Walburga, Contesă Archibald Douglas • Maria Beatrix, Contesă Riprand de Arco-Zinneberg*** • Isabella, Contesă Andrea Czarnocki-Lucheschi*** • Maria del Pilar, Edle Vollrad-Joachim von Poschinger • Kinga, Baronesă Wolfgang de Erffa • Arhiducesa Marie Adelheid, Mrs. Jaime Corcuerra • Arhiducesa Viridis, Mrs. Karl Dunning-Gribble • Arhiducesa Alexandra, Mrs. Héctor Riesle • Maria Constanza, Prințesă de Auersperg-Trautson • Maria Anna, Prințesă Peter Galitzine • Catharina, Contesă Maximiliano Secco d'Aragona • Arhiducesa Elisabeta, Mrs. James Litchfield • Sophie, Prințesă de Windisch-Grätz • Arhiducesa Marie Christine, Mrs. Clemens Guggenberg • Arhiducesa Marie Bernadette, Mrs. Rupert Wolff** • Arhiducesa Katharina, Mrs. Niall Brooks** • Arhiducesa Alicia** • Arhiducesa Maria Christina** • Arhiducesa Margareta, Mrs. Andreas Baumgartner** • Arhiducesa Marie Valerie, Mrs. Martin Josef Wagner** • Arhiducesa Hedwig** • Arhiducesa Veronika** • Arhiducesa Johanna • Arhiducesa Elisabeta • Arhiducesa Celina • Arhiducesa Maria Floriana • Arhiducesa Sdeía • Arhiducesa Anna Carolina • Arhiducesa Theresa • Arhiducesa Sophie • Arhiducesa Ladislaya
