Die Vereine spielten ein Doppelrundenturnier aus, womit sich insgesamt 22 Spiele pro Mannschaft ergaben. Es wurde nach der 3-Punkte-Regel gespielt (drei Punkte pro Sieg, ein Punkt pro Unentschieden). Die Tabelle wurde nach den folgenden Kriterien bestimmt:
Der GFA FC kehrte nach zweijähriger Abstinenz als Zweiter der MNL-2 2016 wieder zurück in die Myanmar National League. Der eigentliche Meister, der Manaw Myay FC, verzichtete auf den Aufstieg. Der zweite Aufsteiger, der Nay Pyi Taw FC, spielte zuletzt in der Saison 2015 in der höchsten myanmarischen Liga.
Aufgrund des Rückzugs des Zayar Shwe Myay FC entging der Vorletzte der Saison 2016, der Southern Myanmar FC, dem Abstieg. Der letztplatzierte Verein, der Horizon FC, musste nach nur einem Jahr in der Myanmar National League wieder in die MNL-2 zurück.
