Les éliminatoires du CHAN 2016 ont lieu dans un groupe composé de la Libye, du Maroc et de la Tunisie, sous la direction d'Henryk Kasperczak et qui se qualifie pour la phase finale avec une victoire, un match nul et deux défaites.
Hatem Missaoui mène l'équipe en phase de groupes au Rwanda, avec de deux nuls contre la Guinée (2-2)[1] et le Nigeria (1-1) et une victoire sur le Niger (5-0), la plus grande de l'histoire du tournoi ; la Tunisie est toutefois éliminée en quarts de finale par le Mali (1-2).