La Coppa UEFA 2003-2004 è stata la 33ª edizione dell'omonima competizione. È stata vinta dal Valencia nella finale giocata contro l'Olympique Marsiglia allo stadio Ullevi di Göteborg; con questo successo, il club spagnolo è diventato il primo e unico tra quelli che avevano vinto in precedenza la Coppa delle Fiere (considerata de facto l'antesignana della moderna manifestazione) a bissare il trionfo in Coppa UEFA.
Il calendario fu modificato tirando in lungo i primi due turni, gli unici giocati in autunno, per aspettare le squadre uscite dalla Champions. Al contrario, si infittì ancor di più il programma invernale e primaverile, cui vennero spostati anche i sedicesimi secondo il modello ancora oggi in vigore.