帕特里克·克拉玛 (德語:Patrick Cramer ,1969年2月3日— ),德国化学家 、结构生物学家 、分子系统生物学家,2020年当选美国国家科学院 外籍院士[ 1] ,2023年6月当选马克斯·普朗克学会 主席。
生平
帕特里克·克拉玛1989年至1995年就读于斯图加特大学 和海德堡大学 化学系[ 2] 。后来他负笈英国布里斯托尔大学 ,以伊拉斯謨計劃 学者身份完成个人部分研究。在英国担任研究生期间,他还供职于剑桥 分子生物学实验室 的艾伦·费斯特 爵士实验室。1995年至1998年,他来到法国格勒诺布尔 ,在欧洲分子生物学实验室 出任克里斯托夫·W·穆勒(Christoph W. Müller)实验室的博士生。1998年,他在海德堡大学获得自然科学博士[ 2] 。1999年至2001年,克拉玛在美国斯坦福大学 罗杰·科恩伯格 (后来于2006年获得诺贝尔化学奖 )的实验室从事博士后 工作,并担任德国科学基金会 会士[ 3] 。
2001年,克拉玛回到德国,出任慕尼黑大学 基因中心生物化学终身教授 ,2004年担任中心全职教授。随后在2004年至2013年,克拉玛担任中心主任[ 4] 。在此期间,他于2007年至2009年出任化学与药学院院长,2010年至2013年出任生物化学系主任[ 2] 。他还在2007年至2013年担任大学研究委员会委员,也是德国科学基金会研究资助网络SFB464的发言人。 [來源請求]
2014年1月1日,克拉玛出任德国哥廷根 马克斯·普朗克生物物理化学研究所 所长[ 2] [ 5] 。
2016年至2022年,出任《细胞 》期刊编委[ 6] 。
2023年6月22日,当选马克斯·普朗克学会 主席[ 7] 。
研究成果
在马克斯·普朗克生物物理化学研究所 担任分子生物学部主任期间,克拉玛依展开了基础研究[ 8] 。他还在哥廷根大学 担任科学主管及名誉教授 。与罗杰·科恩伯格 进行博士后研究期间,克拉玛依确认了细胞核 最大酶 RNA聚合酶Ⅱ 的三维原子结构,为科恩伯格2006年夺得诺贝尔化学奖 的真核转录 分子基础研究发挥关键作用[ 9] 。
克拉玛的实验室研究真核细胞 分子机制,以及其进行基因转录的系统性原则。实验室综合运用各种结构生物研究方法,包括X射线晶体学 、低温电子显微镜 和生物化学工具。实验室还利用功能基因组学 和计算生物学 方法来研究活细胞的转录原则[ 8] 。
克拉玛的小组制作了第一部关于转录启动及延伸的分子电影[ 10] 。此外,克拉玛整合分子生物学和系统生物学的各个方面,研发出分析细胞内RNA代谢 各基础方面的方法。他的长期目标是了解基因组的表现 及调节 。因此,他的实验室开创出一种结合结构和全基因组方法的研究方法,称为分子系统生物学。
2020年4月,克拉玛团队打造了2019冠状病毒 的首个“冠状聚合酶3D结构”[ 11] 。该模型能让研究人员“研究瑞德西韦 等抗病毒药物阻断聚合酶的的工作原理,寻找新的抑制物质”[ 11] 。
克拉玛也投身于德国及整个欧洲生命科学的进一步发展。他是慕尼黑综合蛋白质科学中心 的创办人之一,是慕尼黑分子生物系统研究中心新研究楼建设工程的发起人。此外,克拉玛还是巴伐利亚州 政府科学技术顾问委员会成员,在TTN研究所从事生物伦理学工作。克拉玛依还担任多个国际会议的组织者,同时兼任多个科学委员会和顾问委员会委员。自2016年起,克拉玛担任欧洲分子生物学实验室 理事会联合理事长[ 12] 。
部分著作
原创研究文章
Schwalb, Björn; Michel, Margaux; Zacher, Benedikt; Frühauf, Katja; Demel, Carina; Tresch, Achim; Gagneur, Julien; Cramer, Patrick. TT-seq maps the human transient transcriptome. Science. 2016-06-03, 352 (6290): 1225–1228. Bibcode:2016Sci...352.1225S . ISSN 0036-8075 . PMID 27257258 . S2CID 8549873 . doi:10.1126/science.aad9841 .
Plaschka, C.; Hantsche, M.; Dienemann, C.; Burzinski, C.; Plitzko, J.; Cramer, P. Transcription initiation complex structures elucidate DNA opening. Nature. 2016, 533 (7603): 353–358. Bibcode:2016Natur.533..353P . PMID 27193681 . S2CID 4465762 . doi:10.1038/nature17990 .
Bernecky, Carrie; Herzog, Franz; Baumeister, Wolfgang; Plitzko, Jürgen M.; Cramer, Patrick. Structure of transcribing mammalian RNA polymerase II. Nature. 2016, 529 (7587): 551–554. Bibcode:2016Natur.529..551B . PMID 26789250 . S2CID 4404463 . doi:10.1038/nature16482 . hdl:11858/00-001M-0000-0029-7D45-3 .
Plaschka, C.; Larivière, L.; Wenzeck, L.; Seizl, M.; Hemann, M.; Tegunov, D.; Petrotchenko, E. V.; Borchers, C. H.; Baumeister, W. Architecture of the RNA polymerase II–Mediator core initiation complex. Nature. 2015, 518 (7539): 376–380. Bibcode:2015Natur.518..376P . PMID 25652824 . S2CID 4450934 . doi:10.1038/nature14229 . hdl:11858/00-001M-0000-0024-CED0-5 .
Schulz, Daniel; Schwalb, Bjoern; Kiesel, Anja; Baejen, Carlo; Torkler, Phillipp; Gagneur, Julien; Soeding, Johannes; Cramer, Patrick. Transcriptome surveillance by selective termination of noncoding RNA synthesis. Cell. 2013-11-21, 155 (5): 1075–1087. ISSN 1097-4172 . PMID 24210918 . doi:10.1016/j.cell.2013.10.024 .
Kostrewa, Dirk; Zeller, Mirijam E.; Armache, Karim-Jean; Seizl, Martin; Leike, Kristin; Thomm, Michael; Cramer, Patrick. RNA polymerase II–TFIIB structure and mechanism of transcription initiation. Nature. 2009, 462 (7271): 323–330. Bibcode:2009Natur.462..323K . PMID 19820686 . S2CID 205218821 . doi:10.1038/nature08548 . hdl:11858/00-001M-0000-0015-8570-1 .
Bushnell, David A.; Cramer, Patrick; Kornberg, Roger D. Structural basis of transcription: α-Amanitin–RNA polymerase II cocrystal at 2.8 Å resolution . Proceedings of the National Academy of Sciences. 2002-02-05, 99 (3): 1218–1222. Bibcode:2002PNAS...99.1218B . ISSN 0027-8424 . PMC 122170 . PMID 11805306 . doi:10.1073/pnas.251664698 .
Cramer, P.; Bushnell, D. A.; Fu, J.; Gnatt, A. L.; Maier-Davis, B.; Thompson, N. E.; Burgess, R. R.; Edwards, A. M.; David, P. R. Architecture of RNA polymerase II and implications for the transcription mechanism. Science. 2000-04-28, 288 (5466): 640–649. Bibcode:2000Sci...288..640C . ISSN 0036-8075 . PMID 10784442 . doi:10.1126/science.288.5466.640 . hdl:11858/00-001M-0000-0015-872F-3 .
评论文章
Plaschka, Clemens; Nozawa, Kayo; Cramer, Patrick. Mediator Architecture and RNA Polymerase II Interaction. Journal of Molecular Biology. 2016, 428 (12): 2569–2574. ISSN 0022-2836 . PMID 26851380 . doi:10.1016/j.jmb.2016.01.028 .
Sainsbury, Sarah; Bernecky, Carrie; Cramer, Patrick. Structural basis of transcription initiation by RNA polymerase II. Nature Reviews Molecular Cell Biology. 2015, 16 (3): 129–143. ISSN 1471-0072 . PMID 25693126 . S2CID 32487971 . doi:10.1038/nrm3952 .
Cramer, Patrick. A Tale of Chromatin and Transcription in 100 Structures. Cell. 2014, 159 (5): 985–994. ISSN 0092-8674 . PMID 25416940 . S2CID 8634234 . doi:10.1016/j.cell.2014.10.047 . hdl:11858/00-001M-0000-0024-44B9-9 .
Cheung, Alan C.M.; Cramer, Patrick. A Movie of RNA Polymerase II Transcription. Cell. 2012, 149 (7): 1431–1437. ISSN 0092-8674 . PMID 22726432 . S2CID 18405467 . doi:10.1016/j.cell.2012.06.006 .
Cramer, Patrick. Deciphering the RNA polymerase II structure: a personal perspective. Nature Structural & Molecular Biology. 2006, 13 (12): 1042–1044. ISSN 1545-9993 . PMID 17146456 . S2CID 31141435 . doi:10.1038/nsmb1206-1042 .
其他著作
Aufbruch in die molekulare Systembiology. - Essay for the anniversary edition "20 Jahre Laborjournal", Published in Laborjournal on 11 July 2014.
Entwicklungen in der Biomedizin: Genom-Sequenzierung in Diagnose, Prävention und Therape; Systembiologie und Medizin . In: T. Rendtorff (Hrsg.): Zukunft der biomedizinischen Wissenschaften. Nomos, 2013, ISBN 978-3-8487-0849-9 .
O. Primavesi, P. Cramer, R. Hickel, T. O. Höllmann; W. Schön: Lob der Promotion . Published in Frankfurter Allgemeine Zeitung on 19 July 2013.
J. Hacker, T. Rendtorff, P. Cramer, M. Hallek, K. Hilpert, C. Kupatt, M. Lohse, A. Müller, U Schroth, F. Voigt, M. Zichy. Biomedizinische Eingriffe am Menschen – Ein Stufenmodell zur ethischen Bewertung von Gen- und Zelltherapie . Water de Gruyter, Berlin. ISBN 978-3-11-021306-5 (2009).
主要奖项荣誉
参考资料
外部链接