Questa voce raccoglie le informazioni riguardanti la Pro Patria et Libertate Sezione Calcio nelle competizioni ufficiali della stagione 1945-1946.
Stagione
Nella prima stagione del dopoguerra la FIGC ha unito le squadre di Serie B (come la Pro Patria) e di Serie C, dividendole in tre gironi. I Bustocchi hanno disputato il girone B, un torneo a dodici, nel quale si sono piazzati al secondo posto con 28 punti.
Nel girone finale a sei la Pro Patria ha solo sfiorato la promozione in Serie A giungendo seconda con 11 punti, dietro all'Alessandria.
^Partita rinviata per neve e recuperata il 7 aprile 1946 sul campo neutro di Novara
^Gara vinta dal Legnano 1-0 sul campo il 27 gennaio , ma poi annullata dalla Lega Nazionale Alta Italia per errore tecnico e ripetuta il 4 aprile 1946.