O Campeonato Estadual da Terceira Divisão de Profissionais de 2009 será a vigésima-oitava edição do certame promovido pela FFERJ, que começou em 1981.
Será disputado em cinco fases, no período de julho a novembro. Na primeira as equipes jogam entre si dentro de seus grupos, em turno e returno, passando a fase seguinte as dezesseis melhores pelo índice técnico. Na segunda fase os times serão divididos em quatro grupos com mesmo número de times, que se enfrentam entre si em turno e returno, avançando os dois melhores de cada grupo. Os oito melhores novamente serão agrupados em grupos de quatro times de onde sairão os dois semifinalistas até serem conhecidos os dois times que estarão disputando o título da competição. Os perdedores nas semifinais estarão decidindo, em dois jogos, quem ficará com a terceira vaga no acesso. As três últimas agremiações da Série C darão lugar a três que subirão de divisão.
A novidade deste ano fica por conta da classificação de três equipes para a Segunda Divisão em 2010. A competição, antes mesmo de estrear, sofreu a primeira baixa com a saída do Rio Bonito Atlético Clube, por falta de recursos, adiando a primeira rodada do Grupo B para 1 de agosto.
Grupos e participantes
A composição dos grupos e participantes ficou assim definida:
Observação: Através do Ato da Presidência nº 046/09 o presidente da Federação de Futebol do Estado do Rio de Janeiro, Rubens Lopes, revogou a refiliação concedida de forma provisória ao Real Esporte Clube, por se encontrar em absoluta irregularidade perante o Estatuto e Regulamentos da FFERJ, e, por conseqüência, exclui-lo imediatamente do Campeonato Estadual de Profissionais de 2009, Série C, ora em curso. A razão da exclusão da Terceirona se deu por que a equipe angrense não quitou os débitos junto a entidade pela refiliação da equipe como profissional, mesmo sendo notificada 48 horas antes. Por fim declara o Real perdedor pelo escore de 3 a 0 em todos os jogos programados e não realizados na seqüência do Campeonato Estadual de Profissionais da Série C - 2009.