Na primeira fase, as dez equipes jogaram em turno e returno, todos contra todos. Na fase seguinte, as quatro melhores disputaram um quadrangular, também em jogos de ida e volta. O vencedor deste quadrangular disputou, em duas partidas, a final do campeonato com a equipe melhor classificada na primeira fase. Se a mesma equipe tivesse vencido a primeira fase e o quadrangular final, seria automaticamente campeã do campeonato. Caso tivesse acontecido empate (segundo os critérios de desempate) na fase final, a equipe vencedora da primeira fase seria a campeã do campeonato.[2]
As duas equipes que terminaram no penúltimo e último lugares na classificação da primeira fase, foram rebaixadas para a série A2 de 2010.[3]
Critérios de desempate
Os critério de desempate foram aplicados na seguinte ordem[4]:
b.^ O placar da partida entre Guarany-SE e América de Propriá, realizado em 22 de março, teve seu placar revertido para 3 a 0 em favor do América, conforme o regulamento da competição e decisão do TJD/SE.[7]
a.^ A partida foi interrompida quando o placar estava 2 a 1 a favor do Guarany-SE, porém, por decisão do TJD/SE, o placar foi revertido para 3 a 0 a favor do América de Propriá.[7]
a.^ O placar da partida entre Guarany-SE e América de Propriá, realizado em 22 de março, teve seu placar revertido para 3 a 0 em favor do América, conforme o regulamento da competição e decisão do TJD/SE.[7]
Segue listado abaixo os autores dos 270 gols válidos do torneio. Não estão incluídos os gols da partida entre Guarani e América de Propriá pela décima sexta rodada, cujo placar no momento da paralisação da partida era de 2 a 1 a favor do Guarani, mas que teve seu resultado revertido para 3 a 0, a favor do América, por decisão do TJD-SE.
