A Copa Paulista de Futebol de 2016, foi a 22.ª edição da competição. A Copa Paulista é o segundo torneio em importância a ser organizado pela Federação Paulista de Futebol. O intuito desse campeonato é ocupar durante o segundo semestre times que não disputem competições nacionais ou querem exercitar seu time reserva.
Em 2016 a competição deu o direito ao campeão o direito de escolha entre uma vaga na Copa do Brasil de 2017 ou a Série D de 2017, o vice-campeão ficou com a vaga restante.[1]
Em caso de desistência, preenche a vaga o clube na classificação subsequente.
Não poderão participar do campeonato as equipes rebaixadas da Série A3 de 2016 para a Série B de 2017.
Fórmula de disputa
Primeira fase. Participarão 27 clubes que formarão quatro grupos regionalizados, sendo três grupos com sete clubes cada e um grupo com seis. As equipes jogarão entre si, em turno e returno, classificando-se para a fase seguinte os quatro clubes melhor colocados de cada grupo.
Segunda fase. Os 16 clubes classificados formarão quatro grupos com quatro clubes cada e jogarão entre si, em turno e returno, classificando-se para a fase seguinte os dois clubes melhores colocados de cada grupo e os dois melhores terceiros colocados
Terceira fase (quartas-de-final). Os oito clubes classificados formarão quatro grupos com dois clubes cada e jogarão entre si, em turno e returno, classificando-se para a fase seguinte o clube melhor colocado de cada grupo.
Quarta fase (semifinal). Os quatro clubes classificados formarão dois grupos com dois clubes cada e jogarão entre si, em turno e returno, classificando-se para a fase seguinte o clube melhor colocado de cada grupo.
Quinta fase (final). Os dois clubes classificados jogarão entre si, em turno e returno, para definir o clube campeão e vice-campeão.