Como o MTV Video Music Awards dos Estados Unidos neste evento artistas são premiados e seus vídeos são colocados para votação online dos telespectadores do canal. Inicialmente o Japão fazia parte do MTV Asia Awards, que faziam parte de todos os países do MTV Sudeste da Ásia (Cingapura, Malásia, Hong Kong, Vietnã e Tailândia), mas por causa da variedade musical existente no Japão, em maio de 2002 começou a realizar os seus próprios prêmios de forma independente.
Em 25 de junho de 2011, MTV Video Music Japan mudou para o Evento de Caridade para Sismo e tsunami de Tohoku de 2011 no MTV Video Music Japan Aid de 2011. A partir de 2017, os vencedores são anunciados em sua conta oficial no Instagram.
