PyMOL
 PyMOL logo | |
| Avtor | Warren Lyford DeLano |
|---|---|
| Razvijalec | Schrödinger, Inc. |
| Začetna izdaja | 2000 |
| Stabilna izdaja | 1 februar 2025 |
| Programski jezik | C, C++, Python |
| OS | večplatformski: macOS, Unix, Linux, Windows |
| Okolje | IA-32, x86-64 |
| Razpoložljivi jeziki | angleščina |
| Tip | Molekularno modeliranje |
| Licenca | Originalno Python License,[1] now proprietary[2] |
| Spletno mesto | pymol |
PyMOL je odprtokodni, vendar lastniški[2] sistem molekularne vizualizacije, ki ga je ustvaril Warren Lyford DeLano. Sprva ga je komercializiralo podjetje DeLano Scientific LLC, ki se ukvarja z ustvarjanjem uporabnih orodij, ki naj bi bila univerzalno dostopna znanstvenim in izobraževalnim skupnostim. Trenutno ga trži Schrödinger, Inc. PyMOL lahko ustvari visokokakovostne 3D slike majhnih molekul in bioloških makromolekul, kot so beljakovine.
PyMOL je eno redkih večinoma odprtokodnih orodij za vizualizacijo modelov, ki so na voljo za uporabo v strukturni biologiji. Del imena Py se nanaša na program napisan v programskem jeziku Python.
Barve elementov
PyMOL uporablja barvanje kroglic po elementih.
| ① | |||||||||||||||||||
| ② | |||||||||||||||||||
| ③ | |||||||||||||||||||
| ④ | |||||||||||||||||||
| ⑤ | |||||||||||||||||||
| ⑥ | 
|
||||||||||||||||||
| ⑦ | 
|
||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||
|
|
|||||||||||||||||||
Galerija
-
Primer nekaterih funkcij za urejanje molekul PyMOL, rotacije diedrske vezi in interaktivne molekularne relaksacije z Sculpting mode. o so uporabne funkcije za pripravo vhodne geometrije za programsko opremo kvantne kemije
-
Struktura istih beljakovin (TEV proteaza - PDB: 1LVB) upodobljena na različne načine.
Glej tudi
Sklici
- ↑ »PyMOL Molecular Graphics System«. SourceForge.
- ↑ 2,0 2,1 »Open-Source PyMOL«. Schrodinger, Inc. 5. november 2021. Pridobljeno 7. novembra 2021.
- ↑ »Color Values«. pymolwiki. 2010. Pridobljeno 4. septembra 2021.
Zunanje povezave
Content Disclaimer
Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.
- The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
- There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
- It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
- Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
- Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.
