Berikut merupakan Babak Kualifikasi Piala Dunia FIFA 2006 untuk Zona Asia di bawah naungan AFC.

Sejumlah 42 tim nasional Zona Asia berpartisipasi dalam kualifikasi ini. Namun Kamboja, Filipina, Brunei, dan Bhutan memutuskan untuk tidak turut serta, sementara Myanmar dilarang ikut oleh FIFA karena menolak bermain di Teheran, Iran saat kualifikasi musim lalu. Pada akhirnya, 39 tim ambil bagian, memperebutkan 4 atau 5 tempat di putaran final di Jerman.

Proses kualifikasi dibagi dalam tiga babak.

• Babak Pertama: 14 tim berperingkat terendah menurut FIFA dibagi 2 – 2 dan akan bermain satu sama lain kandang – tandang. 7 tim pemenang akan bergabung dengan 25 tim lain yang langsung lolos ke Babak Kedua.
• Babak Kedua: 25 tim yang otomatis lolos ke babak ini ditambah 7 tim yang lolos dari Babap Pertama dibagi dalam 8 grup yang masing – masing terdiri atas 4 tim yang akan bermain satu sama lain kandang – tandang. Pemuncak masing – masing grup akan melaju ke Babak Ketiga.
• Babak Ketiga: 8 tim tersisa dibagi menjadi 2 grup yang masing – masing terdiri atas 4 tim. 2 tim pemuncak masing – masing grup akan melaju ke putaran final. Sementara, peringkat ketiga masing – masing grup akan bermain kandang – tandang dan pemenangnya akan mewakili AFC dalam pertandingan play-off melawan wakil CONCACAF untuk mendapatkan tiket ke putaran final.

Jika 2 atau lebih tim yang imbang dalam perolehan poin dalam akhir pertandingan babak penyisihan grup, tim yang imbang akan diperingkatkan menurut ketentuan berikut, yaitu:

1. jumlah poin yang lebih ditinggi yang diraih dalam pertandingan antara tim yang imbang
2. selisih gol dalam pertandingan antara tim yang imbang
3. jumlah gol yang dicetak dalam pertandingan antara tim yang imbang
4. selisih gol dalam seluruh pertandingan babak grup
5. jumlah gol yang dicetak dalam seluruh pertandingan babak grup
6. hasil dari sebuah pertandingan play-off di sebuah stadion netral, dengan perpanjangan waktu dan adu penalti jika diperlukan
7. pengundian yang dilakukan pada acara final

Tim 1	Agregat	Tim 2	Leg 1	Leg 2
Turkmenistan	13–0	Afganistan	11–0	0–2
Tionghoa Taipei	6–1	Makau	3–0	1–3
Bangladesh	0–4	Tajikistan	0–2	2–0
Laos	0–3	Sri Lanka	0–0	3–0
Pakistan	0–6	Kirgizstan	0–2	4–0
Mongolia	0–13	Maladewa	0–1	12–0
Guam	—	Nepal	—	—

Guam dan Nepal yang seharusnya bermain satu sama lain, mengundurkan diri, sehingga FIFA memutuskan untuk memilih tim terbaik yang gagal melaju namun beruntung, yang nantinya akan melaju ke babak kedua. Para tim yang gagal melaju dibandingkan, dengan menggunakan kriteria "tie-break" sebagai berikut:

1. jumlah poin yang lebih ditinggi yang diraih dalam pertandingan
2. selisih gol dalam pertandingan yang telah dilakukan
3. jumlah gol yang dicetak dalam pertandingan yang telah dilakukan

Dari hasil pembandingan seluruh tim yang gagal melaju, Laos keluar sebagai tim terbaik dan melaju ke babak kedua.

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Iran	6	5	0	1	22	4	+18	15	Lolos ke babak ketiga		—	0–1	3–1	7–0
2	Yordania	6	4	0	2	10	6	+4	12			0–2	—	1–0	5–0
3	Qatar	6	3	0	3	16	8	+8	9			2–3	2–0	—	5–0
4	Laos	6	0	0	6	3	33	−30	0			0–7	2–3	1–6	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Uzbekistan	6	5	1	0	16	3	+13	16	Lolos ke babak ketiga		—	1–1	3–0	6–1
2	Irak	6	3	2	1	17	7	+10	11			1–2	—	4–1	6–1
3	Palestina	6	2	1	3	11	11	0	7			0–3	1–1	—	8–0
4	Tionghoa Taipei	6	0	0	6	3	26	−23	0			0–1	1–4	0–1	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Jepang	6	6	0	0	16	1	+15	18	Lolos ke babak ketiga		—	1–0	7–0	1–0
2	Oman	6	3	1	2	14	3	+11	10			0–1	—	0–0	7–0
3	India	6	1	1	4	2	18	−16	4			0–4	1–5	—	1–0
4	Singapura	6	1	0	5	3	13	−10	3			1–2	0–2	2–0	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Kuwait	6	5	0	1	15	2	+13	15	Lolos ke babak ketiga		—	1–0	4–0	6–1
2	Tiongkok	6	5	0	1	14	1	+13	15			1–0	—	7–0	4–0
3	Hong Kong	6	2	0	4	5	15	−10	6			0–2	0–1	—	2–0
4	Malaysia	6	0	0	6	2	18	−16	0			0–2	0–1	1–3	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Korea Utara	6	3	2	1	11	5	+6	11	Lolos ke babak ketiga		—	0–0	4–1	2–1
2	Uni Emirat Arab	6	3	1	2	6	6	0	10			1–0	—	1–0	3–0
3	Thailand	6	2	1	3	9	10	−1	7			1–4	3–0	—	1–1
4	Yaman	6	1	2	3	6	11	−5	5			1–1	3–1	0–3	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Bahrain	6	4	2	0	15	4	+11	14	Lolos ke babak ketiga		—	2–1	4–0	5–0
2	Suriah	6	2	2	2	7	7	0	8			2–2	—	2–1	0–1
3	Tajikistan	6	2	1	3	5	9	−4	7			0–0	0–1	—	2–1
4	Kirgizstan	6	1	1	4	5	12	−7	4			1–2	1–1	1–2	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Korea Selatan	6	4	2	0	9	2	+7	14	Lolos ke babak ketiga		—	2–0	2–0	2–0
2	Lebanon	6	3	2	1	11	5	+6	11			1–1	—	0–0	3–0
3	Vietnam	6	1	1	4	5	9	−4	4			1–2	0–2	—	4–0
4	Maladewa	6	1	1	4	5	14	−9	4			0–0	2–5	3–0	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Arab Saudi	6	6	0	0	14	1	+13	18	Lolos ke babak ketiga		—	3–0	3–0	3–0
2	Turkmenistan	6	2	1	3	8	10	−2	7			0–1	—	3–1	2–0
3	Indonesia	6	2	1	3	8	12	−4	7			1–3	3–1	—	1–0
4	Sri Lanka	6	0	2	4	4	11	−7	2			0–1	2–2	2–2	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Arab Saudi	6	4	2	0	10	1	+9	14	Lolos ke putaran final		—	2–0	3–0	3–0
2	Korea Selatan	6	3	1	2	9	5	+4	10			0–1	—	2–1	2–0
3	Uzbekistan	6	1	2	3	7	11	−4	5	Lolos ke play-off		1–1	1–1	—	3–2
4	Kuwait	6	1	1	4	4	13	−9	4			0–0	0–4	2–1	—

Pos	Tim l b s	Main	M	S	K	MG	KG	SG	Poin	Kualifikasi
1	Jepang	6	5	0	1	9	4	+5	15	Lolos ke putaran final		—	2–1	1–0	2–1
2	Iran	6	4	1	1	7	3	+4	13			2–1	—	1–0	1–0
3	Bahrain	6	1	1	4	4	7	−3	4	Lolos ke play-off		0–1	0–0	—	2–3
4	Korea Utara	6	1	0	5	5	11	−6	3			0–2	0–2	1–2	—

Tim 1	Agregat	Tim 2	Leg 1	Leg 2
Uzbekistan	1–1 (p.g.t.)	Bahrain	1–1	0–0

• (Inggris) Dokumentasi Diarsipkan 2009-02-23 di Wayback Machine. pada situs web resmi FIFA.
• (Inggris) Arsip pada situs RSSSF.
• (Jerman) Dokumentasi Diarsipkan 2009-03-13 di Wayback Machine. pada situ Weltfussball.de