בארץ ישראל החלו לשחק כדורגל כבר בתחילת המאה ה-20. במהלך השנים התפתחו מספר קבוצות והליגה הראשונה בארץ הוקמה על ידי נציגי שלטון המנדט הבריטי. בשנות ה-30 הוקמה נבחרת ארץ ישראל שהפכה לאחר קום המדינה לנבחרת ישראל. בתחילה הייתה הנבחרת חלשה ביותר, והטורניר המשמעותי הראשון בו השתתפה היה מוקדמות מונדיאל 1934, בו הובסה 2 - 11 בסיכום שני המשחקים מול מצרים. ברבות השנים התפתח הכדורגל הישראלי, כדורגלנים ישראלים הצטיינו במועדונים בכירים בכדורגל העולמי, ובדומה לרבות ממדינות העולם, היה הכדורגל לענף הספורט המוביל בארץ מבחינת עניין הקהל.
מסגרות הליגה בכדורגל הישראלי כוללות את הליגה הבכירה, ליגת העל (בעבר "ליגה א'" ובהמשך "הליגה הלאומית") ואחריה הליגה הלאומית וליגות המשנה א', ב' וג', שמפוצלות לפי אזורים. בעבר התקיימה הליגה הארצית, שאוחדה לליגה הלאומית ולליגה א', במקביל להרחבת מספר הקבוצות המשחקות בכל ליגה. הקבוצות שמסיימות במקומות הראשונים בליגת העל מעפילות למסגרות האירופיות הבינלאומיות ליגת האלופות, הליגה האירופית והקונפרנס ליג בהנהלת אופ"א. בליגות הנמוכות יותר הקבוצות שמסיימות ראשונות מעפילות לליגה הבאה בדרג, במקביל לקבוצות שמסיימות במקומות האחרונים, שיורדות לליגה בדרג נמוך יותר. לצד הליגות מתקיימים טורנירים בשיטת נוקאאוט, שבסופם מוענק גביע למנצחת, בהם גביע המדינה וגביע הטוטו. הקבוצה שזוכה בגביע המדינה אף מעפילה למוקדמות הקונפרנס ליג של אופ"א. בנוסף, מאז 1999 מתקיימת ליגת כדורגל נשים ישראלית וכן נבחרת נשים שערכה את משחקה הראשון ב-1977.
על הפעלת הליגות והגביעים אחראית ההתאחדות לכדורגל בישראל, שנוסדה ב-1928, בתקופת המנדט הבריטי, והצטרפה ב-1929 לארגון פיפ"א העולמי. ההתאחדות אחראית גם על נבחרת ישראל הבוגרת ועל הנבחרות הצעירות, ומפקחת על הקבוצות השונות, לרבות קיום בית דין האחראי לפיקוח ואכיפת משמעת. על שיבוץ השופטים למשחקים השונים אמון איגוד השופטים המהווה גוף אוטונומי.
ההתאחדות לכדורגל בישראל - עמותה אשר אחראית על הכדורגל בישראל. העמותה מאגדת את כל קבוצות הכדורגל בישראל, ואחראית על הליגות ומשחקי הגביע בישראל (בכל הגילאים), בנוסף לנבחרות הכדורגל השונות בכל הגילאים.
הרשות לבקרת תקציבים - הגוף אשר אחראי על הבקרה התקציבית של קבוצות הכדורגל בישראל. הרשות אחראית על פיקוח של המצב הפיננסי של הקבוצות, והקריטריונים הפיננסים של אופ"א.
איגוד השופטים - האיגוד אשר אחראי על שיבוץ השופטים לטורנירים השונים (ליגות וגביעים) אשר מתקיימים בישראל. מחולק ל-4 אזורים, וכל שופט עובד באזור בו שובץ.
איגוד המאמנים - איגוד שמטרתו היא קידום הרמה המקצועית והגנה על הזכויות של מאמנים בישראל. מארגן השתלמויות ופגישות למאמני כדורגל שונים, מרחבי הארץ.
ליגת העל בכדורגל - הליגה המקצוענית הבכירה בכדורגל בישראל, שהוקמה בשנת 1931 ומונה 14 קבוצות. השם "ליגת העל" נקבע לראשונה בעונת 1999/2000. עד אז נקראה הליגה הבכירה בשם הליגה הלאומית (החל מעונת 1955/1956) ולפני כן נקראה ליגה א'. הקבוצה המסיימת את העונה במקום הראשון בליגה מוכרזת באלופת המדינה, ושלוש הקבוצות המסיימות ראשונות מקבלות הזדמנות להשתתף בליגת האלופות ובקונפרנס ליג בעונה הבאה, ושתי הקבוצות שמסיימות במקומות האחרונים בליגת העל יורדות לליגה הלאומית.
הליגה הלאומית בכדורגל - הליגה המקצוענית השנייה בחשיבותה בכדורגל הישראלי. בליגה הלאומית משחקות 16 קבוצות. בין 1976 ל-1999 נקראה הליגה השנייה בשם "הליגה הארצית". בשנת 1999 קיבלה הליגה השנייה את שמה הנוכחי. בסוף כל עונה עולות שתי הקבוצות הבכירות בליגה לליגת העל. שתי המדורגות אחרונות בליגה הלאומית יורדות לליגה א' לפי מיקומן הגאוגרפי.
ליגה א' - הליגה השלישית בחשיבותה. קבוצות ליגה א' מחולקות לשתי ליגות נפרדות על פי מיקומן הגאוגרפי: ליגה א' צפון וליגה א' דרום. אין קו חלוקה רשמי משום שהחלוקה תלויה בהרכב הקבוצות בליגה. בפועל, האזור הגבולי הינו צפון השרון. בתום העונה, עולות לליגה הלאומית המדורגות ראשונות בליגה א', האחת מליגה א' צפון והשנייה מליגה א' דרום. שתי הקבוצות המדורגות אחרונות בכל אחת משתי הליגות המרכיבות את ליגה א' יורדות לליגה ב'.
ליגה ב' - הליגה הרביעית בחשיבותה. ליגה ב' מורכבת מארבע ליגות נפרדות המורכבות מקבוצות לפי מיקומן הגאוגרפי: ליגה ב' צפון א', ליגה ב' צפון ב', ליגה ב' דרום א' וליגה ב' דרום ב'. ארבע הזוכות בליגה זו, האחת מליגה ב' צפון א', השנייה מליגה ב' צפון ב', השלישית מליגה ב' דרום א' והרביעית מליגה ב' דרום ב' עולות לליגה א' לפי מיקומן הגאוגרפי. מונה הקבוצות הכי פחות טובות בכל אחת מארבע הליגות המרכיבות את ליגה ב' יורדות לליגה ג'.
ליגה ג' - הליגה החמישית בחשיבותה והנמוכה ביותר בכדורגל הישראלי. הליגה מורכבת משבעה מחוזות, כאשר אלופות כל אחד המחוזות עולות לליגה ב'. בעבר היו בליגה ג' 12 מחוזות, אבל התפרקותן של קבוצות רבות הביאה לצמצום מספר המחזות בהדרגתיות.
הליגה הארצית (התפרקה) - הייתה הליגה השלישית ולפני כן השנייה בחשיבותה בכדורגל בישראל. בתום עונת 2008/2009 בעקבות שינוי מבנה הליגות הבכירות בישראל, בוטלה ליגה זו. הוקמה בשנת 1976 כליגה שנייה מתחת לליגה הלאומית ומעל לליגה א' שהייתה עד אז הליגה השנייה בישראל. לפי ההחלטה, 4 הקבוצות האחרונות בליגה הלאומית (שהייתה אז הליגה הראשונה) בתוספת 4 הקבוצות במקומות 2-5 בליגה א' דרום וצפון הרכיבו את הליגה הארצית.
גביע המדינה - המפעל השני בחשיבותו בכדורגל הישראלי. כל הקבוצות בכל הליגות בארץ משתתפות בו, וכל קבוצה מצטרפת בשלב שונה (סיבובים א'-ד'- הקבוצות מליגות ב' וג'. סיבוב ה'-הקבוצות מליגה א', סיבוב ז'- הקבוצות מליגה לאומית, ובסיבוב ח' הקבוצות מליגת העל). משחקי הגביע משוחקים בשיטת נוק-אאוט, ושיאנית הזכיות (נכון ל-2021), היא מכבי תל אביב עם 24 זכיות
גביע הטוטו - טורניר גביע הליגה של קבוצות ליגת העל והליגה הלאומית (בעבר בוצע בליגה הארצית, אך בוטל שהליגה בוטלה). זוהי התחרות השלישית בחשיבותה בכדורגל הישראלי. מבנה הגביע כולל שלב בתים ושלבי נוק-אאוט, בשיטת בית וחוץ. שיאנית הזכיות בליגת העל היא מכבי תל אביב עם 7 זכיות, והשיאניות בליגה הלאומית הן הכח רמת גן ומכבי יפו, עם 3 זכיות לכל קבוצה. בליגה הארצית השיאניות הן הפועל רמת גן והפועל אשקלון, עם 3 זכיות לכל אחת.
מצבה של הנבחרת הושפע ממעמדה הדיפלומטי והבינלאומי של מדינת ישראל. לאורך שנותיה נתקלה הנבחרת במספר מקרים שבהם סירבו יריבותיה לשחק נגדה מטעמים פוליטיים. ישראל השתייכה מבחינה גאוגרפית לאסיה, אך בלחץ מדינות ערב היא הוצאה מקונפדרציית הכדורגל של אסיה בשנות ה-70, ובעקבות כך עברה לשחק באזור אוקיאניה במוקדמות המונדיאל. ב-1993 הצטרפה ישראל כחברה קבועה באופ"א, התאחדות הכדורגל של אירופה.
לב יאשין, מגדולי השוערים בכל הזמנים, לאחר שער שהבקיע לו נחום סטלמך במשחק הנבחרת מול ברית המועצות ב-1956. היה זה שערו הראשון של סטלמך בנבחרת במשחקו השני במדיה.
סגל הנבחרת מורכב ממיטב שחקני הכדורגל המחזיקים באזרחות ישראלית. מאמן הנבחרת, שמכונה "המאמן הלאומי", הוא זה שבוחר את סגל השחקנים ומדריך אותם לקראת המשחקים הבינלאומיים. המאמן ממונה על ידי ההתאחדות לכדורגל בישראל, הגוף המנהלי החולש על הכדורגל הישראלי בכלל ועל נבחרת ישראל בפרט. בנוסף, משתייכת הנבחרת לארגון אופ"א האירופי. כיום מתמודדת נבחרת ישראל בשני מפעלים בינלאומיים, שהם מוקדמות גביע העולם בכדורגל ומוקדמות אליפות אירופה בכדורגל.
הנבחרת הצעירה של ישראל (ידועה גם בתור הנבחרת האולימפית) היא נבחרת הכדורגל הלאומית של ישראל עד גיל 21. סגל הנבחרת מורכב ממיטב שחקני הכדורגל המחזיקים באזרחות ישראלית שגילם מתחת ל-21, אף כי גילם יכול להגיע גם ל-23 במקרים מסוימים. מאמן הנבחרת ממונה על ידי ההתאחדות לכדורגל בישראל.
נבחרת הנוער של ישראל היא נבחרת הכדורגל הלאומית של ישראל עד גיל 19, ולעיתים גם גיל 20. האצטדיון העירוני בהרצליה משמש את נבחרת הנוער במשחקיה, כמו גם את הנבחרת האולימפית. כמו בנבחרת האולימפית, את מאמן נבחרת הנוער ממנה ההתאחדות לכדורגל. ב-2007 זכתה נבחרת הנוער בגביע טורניר החלב שנערך בצפון אירלנד.
נבחרת הנערים של ישראל בכדורגל מייצגת את ישראל בטורנירי כדורגל בינלאומיים לשחקנים עד גיל 17. הנבחרת מנוהלת על ידי ההתאחדות לכדורגל בישראל ומשתייכת לאופ"א ולפיפ"א, ובמסגרת זו מתחרה בקביעות במוקדמות אליפות אירופה עד גיל 17. בעבר הנבחרת הורכבה משחקנים עד גיל 16. לאורך שנותיה השתתפה הנבחרת תשע פעמים בטורניר הגמר של אליפות אירופה.
עוד בטרם נוסדה ההתאחדות לכדורגל, מציע סראלפרד מונד, מראשי יהדות בריטניה, להקים נבחרת ארצית ראשונה שתערוך מסע משחקים באנגליה. הארגונים "מכבי" ו"הפועל", שאיתם נפגש מונד, יוזמים תחרות לקביעת סגל הנבחרת. בשל מחלוקת רבה שנוצרה בין הקבוצות המשתתפות, בעיות משמעת והחשש מפני יכולת מקצועית ירודה של הכדורגלנים הארץ-ישראלים, יורד הרעיון מהפרק.
בהדרכת שמעון רוטנר מקיימת נבחרת ארץ ישראל את משחקה הראשון במוקדמות המונדיאל נגד מצרים בקהיר, ומפסידה בו 1 - 7. במשחק הגומלין בתל אביב היא מפסידה 1 - 4 ולא מצליחה להעפיל לטורניר.
הנבחרת תחת אגון פולק פוגשת את יוון במוקדמות המונדיאל, בטורניר הרשמי האחרון שלה בתקופת המנדט הבריטי. במשחק הראשון מפסידה ישראל 1 - 3, ובמשחק הגומלין מפסידה 0 - 1 עקב בעיטת עונשין בדקת הסיום, על אף שהפגינה יכולת טובה.
ישראל מתמודדת במוקדמות אולימפיאדת מלבורן נגד ברית המועצות החזקה, בשורותיה שיחק לב יאשין, מגדולי השוערים בתולדות הכדורגל. במשחק הראשון במוסקבה הובסה בתוצאה 0 - 5, כשהשוער יעקב חודורוב מונע הפסד כבד יותר. במשחק הגומלין הבקיע נחום סטלמך שער שוויון בנגיחה לזכות הנבחרת, אשר נחשב לאחד מהשערים הזכורים בתולדותיה. על אף שהפסידה לבסוף 1 - 2 זכתה הנבחרת להערכה על יכולת הגנתית טובה.
בעקבות פרישתן של טורקיה, אינדונזיה וסודאן שהוגרלו להתמודד מולה במוקדמות המונדיאל, אמורה ישראל להעפיל באופן אוטומטי לגביע העולמי בשוודיה. ואולם, פיפ"א קובעת כי נבחרת חייבת לשחק לפחות פעם אחת על מנת להעפיל לטורניר, ומגרילה מולה את ויילס, אשר הובלה בידי החלוץ הידוע ג'ון צ'ארלס. הנבחרת מפסידה 0 - 2 בשני המשחקים, אך זוכה למחמאות על המאמצים שהפגינה, ובפרט יעקב חודורוב שהמשיך לשחק גם לאחר שנפצע משמעותית.
תחת המאמן ההונגריגיולה מאנדי, שמנהיג חידושים בנבחרת, מתמודדת ישראל בכבוד במוקדמות אולימפיאדת רומא שם הוגרלה מול יוגוסלביה ויוון. הישגיה המפתיעים של הנבחרת מול יוגוסלביה החזקה בלטו במיוחד במהלך הטורניר. במשחק הביתי ברמת גן סיימה ישראל בתיקו 2 - 2, ואילו בבלגרד גברה על יריבתה 2 - 1 בזכות צמד שערים של רפי לוי. אף על פי כן, ישראל מסיימת שנייה ליוגוסלביה בטבלת הבית בשל הפרש שערים נחות ולא מצליחה להעפיל לאולימפיאדה.
נבחרת ישראל משתתפת לראשונה בתולדותיה במשחקים האולימפיים במקסיקו סיטי, תחת הדרכתו של עמנואל שפר. היא הוגרלה בשלב הבתים מול אל סלבדור, הונגריה ומרוקו, שהוחלפה על ידי גאנה מאחר שסירבה להתייצב למשחק מול ישראל. בפתיחת הטורניר ניצחה הנבחרת 5 - 3 את הגנאים במפגש רווי אלימות, ובמשחק הבא גברה 3 - 1 על אל סלבדור. על אף שהפסידה להונגריה במשחק האחרון העפילה הנבחרת לרבע הגמר, שם פגשה את בולגריה. לאחר תיקו 1 - 1 בתום ההארכה נערכה הגרלה לקביעת זהות המנצחת, ובה זכו הבולגרים.
המונדיאל במקסיקו: בהופעת הבכורה שלה אי פעם בטורניר, מוגרלת ישראל מול נבחרות איטליה, אורוגוואי ושוודיה בשלב הבתים. בפתיחת משחקיה הפסידה הנבחרת בתוצאה 0 - 2 לאורוגוואי. במשחק השני השיגה ישראל תיקו 1 - 1 מול שוודיה, כשמרדכי שפיגלר מבקיע את השער היחיד של הנבחרת בתולדות המונדיאלים, לאחר מסירה שקיבל מגיורא שפיגל. במשחק הבא סיימה ישראל בתיקו מאופס מול אלופת אירופהאיטליה בזכות משחק הגנה חזק שהציגה. על אף שסיימה במקום האחרון בבית, נחשבו הישגיה של ישראל למכובדים בהתחשב ביריבותיה החזקות.
נבחרת הכדורגל משתתפת במשחקים האסיאתיים שהתקיימו בטהראן. לאורך התחרויות נתקלה המשלחת באווירה עוינת ובשיבושים טכניים רבים מצד האיראנים ושאר המדינות האסיאתיות. ישראל הצליחה להעפיל למשחק הגמר, שם הפסידה 0 - 1 לנבחרת המארחת, ובמהלכו ספגה גידופים רבים מהקהל האיראני העוין. בתום התחרות החליטה הפדרציה האסיאתית לסלק את ישראל מהמשחקים הבאים.
בהדרכת הצמד יצחק שניאור ויעקב גרונדמן (שקיבלו את הכינוי ש"ג), הנבחרת מתמודדת באזור האוקיאני של מוקדמות מונדיאל 1990 וגוברת על אוסטרליה וניו זילנד בבית הגמר. בפלייאוף הבין-יבשתי שהכריע את המוקדמות התמודדה מול קולומביה. את המשחק הראשון הפסידה 0 - 1 ואילו במשחק הגומלין, שהתקיים ברמת גן, סיימה בתיקו ללא שערים, ולפיכך כשלה בניסיונה להעפיל לטורניר.
ישראל מתמודדת לראשונה במוקדמות המונדיאל כחברה מלאה באופ"א. לקראת סיום המשחקים חוללה הנבחרת את אחת מההפתעות הגדולות ביותר בתולדותיה, כשניצחה בפריז את נבחרת צרפת, מהחזקות בעולם דאז, בתוצאה 3 - 2. בזכות שערים של רונן חרזי ואייל ברקוביץ' עמדה תוצאת המשחק על תיקו, אך ראובן עטר הבקיע את שער הניצחון דקה לסיום. רוני רוזנטל היה אחד מהמצטיינים במשחק ובישל את כל שלושת שערי הנבחרת. על אף שסיימה במקום האחרון בבית, ניצחונה של ישראל מנע מהצרפתים להעפיל למונדיאל.
השנה הבולטת ביותר במשחקי ידידות של הנבחרת. לאחר שניצחה את טורקיה, פולין ורומניה, אירחה ישראל את נבחרת ארגנטינה הבכירה באצטדיון טדי, כחלק מחגיגות יובל להקמת המדינה. בניגוד לכל הציפיות ניצחה ישראל 2 - 1, בעקבות שער של חיים רביבו בבעיטה חופשית, במה שתואר כ"שיא שהכה גלים בכל העולם".
על הישג הנבחרת העיבה "פרשת נערות הליווי" – ערב המשחק הראשון מול דנמרק ארחו חלק משחקניה נערות ליווי בחדרי המלון שלהם, וספגו על כך ביקורת רבה. בצל הפרשה הובסה ישראל 0 - 5 במשחק עצמו, ואילו בגומלין שהתקיים בקופנהגן הפסידה 0 - 3. בעקבות הנזק התדמיתי הכבד, בין היתר, פוטר שרף מאימון הנבחרת בתום הקמפיין.
ליגת כדורגל נשים קמה לראשונה בישראל בשנת 1999. כיום (2019), יש 27 קבוצות כדורגל נשים בארץ, 9 מהן משחקות בליגת העל, 10 בליגה הלאומית ו-8 בליגה הארצית לנשים. כמו כן יש ליגות נערות וילדות, וישנו גם גביע המדינה בכדורגל נשים.
יש מספר הבדלים בין כדורגל הנשים לכדורגל הגברים בארץ. ראשית, בכדורגל הנשים יש 4 סיבובים בליגה, ולא 2 ופלייאוף, כמו בכדורגל הגברים. שנית, בכדורגל נשים מותרים 7 חילופים במשחק, ולא 3 כמו בכדורגל הגברים.
הקבוצות הבולטות ביותר בכדורגל הנשים, הן מכבי חולון, שזכתה בדאבל במשך 6 שנים (אליפות וגביע), חוץ מעונת 2003/04, בה לא התקיים גביע. עוד קבוצה בולטת היא אס"א תל אביב (אגודת ספורט אוניברסיטת תל אביב), שזכתה ב-8 אליפויות ו-5 גביעים. כמו כן, אס"א תל אביב עלתה לסיבוב השני בליגת האלופות לנשים ב-2011/12.