Em 30 de janeiro iniciou a disputa do primeiro campeonato da temporada, o Campeonato Paulista. Na sequência da temporada disputou a Copa do Brasil e o Campeonato Brasileiro. Foi campeão do Campeonato Paulista pela 22ª vez sendo o clube que mais venceu na era profissional. No campeonato desse ano foram 11 vitórias, 7 empates e apenas 1 derrota.[2][3] Na Copa do Brasil teve a oportunidade de enfrentar pela primeira vez na história do clube um time do Amapá, o Santos-AP, pela primeira fase da competição. Depois eliminou Galvez, Gama e Vasco, chegando até as quartas de finais quando foi eliminado pelo Internacional.[4][5] No Campeonato Brasileiro foi vice campeão, realizando a sua melhor campanha da década até então e se classificando para a Copa Libertadores depois de cinco anos.[6][7]
Essa temporada também ficou marcada pelos 100 anos da Vila Belmiro marcado com a realização de um amistoso contra o Benfica em comemoração da data. A partida marcou a despedida dos ídolos Léo e Giovanni e terminou em 1 a 1.[8]
Amistoso de comemoração dos 85 anos do Esporte Clube Bahia. O local e a data da partida foram decididos pela torcida do clube baiano, por meio de votação.[1]
No dia 8 de outubro de 2016, a Vila recebeu um amistoso entre Santos e Benfica, em comemoração dos 100 anos do estádio, o adversário escolhido pelo Santos foi o Benfica, em alusão a decisão do Mundial Interclubes de 1962. A partida marcou a despedida dos ídolos Léo e Giovanni.[8] A partida terminou empatada em 1 a 1, gols do zagueiro Fabián Noguera (Santos) e Salvio (Benfica):
↑ abO jogo da 38ª rodada entre Chapecoense e Atlético Mineiro foi cancelado depois que ambas as equipes se recusaram a jogar após o acidente do avião da equipe da Chapecoense.[10] Ambas as equipes receberam um duplo walkover (derrota por 0–3).[11]
↑O Santa Cruz foi penalizado com a perda de três pontos por atraso no pagamentos de salários.
Desempenho por rodada
Desempenho do Santos por rodada:
Desempenho por rodada do Santos F. C. no Brasileirão 2016
↑«Na Liberta! Fogão e Furacão carimbam passaporte». CBF. Consultado em 11 de dezembro de 2016. Na Arena Condá, em Chapecó (SC), a partida entre Chapecoense e Atlético-MG não aconteceu e as equipes ficaram um W.O. duplo, que consistiu em derrota por 3 a 0 para cada um dos tempos. A Chape fechou a competição com 52 pontos, no 11º lugar, e o Galo ficou na quarta posição, com 62. (Na Arena Condá, em Chapecó (Santa Catarina), a partida entre Chapecoense e Atlético Mineiro não aconteceu e as equipes recebem uma vitória fácil dupla, que consiste na derrota para as duas equipes por 3 a 0. A Chape encerrou a competição com 52 pontos, na 11ª colocação, e o Galo terminou na quarta posição, com 62.)
Information related to Temporada do Santos Futebol Clube de 2016
Ver artigo principal: Campeonato Paulista de Futebol de 2016 - Série A1
.svg){kind=small}
.png){kind=small}
